Preguntas etiquetadas con lme4-nlme

¿Cómo se pueden obtener pesos de regresión estandarizados (efecto fijo) a partir de una regresión multinivel? Y, como un "complemento": ¿Cuál es la forma más fácil de obtener estos pesos estandarizados de un objeto mer(de la lmerfunción del lme4paquete R)?

11 r  multilevel-analysis  lme4-nlme  regression-coefficients  standardization 

El mgcvpaquete Rtiene dos funciones para ajustar las interacciones del producto tensorial: te()y ti(). Entiendo la división básica del trabajo entre los dos (ajustar una interacción no lineal versus descomponer esta interacción en efectos principales y una interacción). Lo que no entiendo es por qué te(x1, x2)y ti(x1) + ti(x2) …

11 r  gam  mgcv  conditional-probability  mixed-model  references  bayesian  estimation  conditional-probability  machine-learning  optimization  gradient-descent  r  hypothesis-testing  wilcoxon-mann-whitney  time-series  bayesian  inference  change-point  time-series  anova  repeated-measures  statistical-significance  bayesian  contingency-tables  regression  prediction  quantiles  classification  auc  k-means  scikit-learn  regression  spatial  circular-statistics  t-test  effect-size  cohens-d  r  cross-validation  feature-selection  caret  machine-learning  modeling  python  optimization  frequentist  correlation  sample-size  normalization  group-differences  heteroscedasticity  independence  generalized-least-squares  lme4-nlme  references  mcmc  metropolis-hastings  optimization  r  logistic  feature-selection  separation  clustering  k-means  normal-distribution  gaussian-mixture  kullback-leibler  java  spark-mllib  data-visualization  categorical-data  barplot  hypothesis-testing  statistical-significance  chi-squared  type-i-and-ii-errors  pca  scikit-learn  conditional-expectation  statistical-significance  meta-analysis  intuition  r  time-series  multivariate-analysis  garch  machine-learning  classification  data-mining  missing-data  cart  regression  cross-validation  matrix-decomposition  categorical-data  repeated-measures  chi-squared  assumptions  contingency-tables  prediction  binary-data  trend  test-for-trend  matrix-inverse  anova  categorical-data  regression-coefficients  standard-error  r  distributions  exponential  interarrival-time  copula  log-likelihood  time-series  forecasting  prediction-interval  mean  standard-error  meta-analysis  meta-regression  network-meta-analysis  systematic-review  normal-distribution  multiple-regression  generalized-linear-model  poisson-distribution  poisson-regression  r  sas  cohens-kappa 

Estoy trabajando en un conjunto de datos para evaluar el impacto del secado en las actividades microbianas de sedimentos. El objetivo es determinar si el impacto del secado varía entre los tipos de sedimentos y / o la profundidad dentro del sedimento. El diseño experimental es el siguiente: El primer …

11 mixed-model  interaction  post-hoc  lme4-nlme 

Recientemente me dijeron que no era posible incorporar covariables variables en el tiempo en modelos longitudinales mixtos sin introducir un retraso de tiempo para estas covariables. ¿Puedes confirmar / negar esto? ¿Tiene alguna referencia sobre esta situación? Propongo una situación simple para aclarar. Suponga que he repetido medidas (por ejemplo, …

11 r  mixed-model  lme4-nlme 

Estoy tratando de reproducir varias pruebas de interacción entre ambas lmy lmeren medidas repetidas (2x2x2). La razón por la que quiero comparar ambos métodos es porque el GLM de SPSS para medidas repetidas produce exactamente los mismos resultados que el lmenfoque presentado aquí, por lo que al final quiero comparar …

10 anova  mixed-model  lme4-nlme  repeated-measures  lm 

Estoy tratando de calcular las predicciones de efectos aleatorios de un modelo mixto lineal a mano, y usando la notación proporcionada por Wood en modelos aditivos generalizados: una introducción con R (pg 294 / pg 307 de pdf), me estoy confundiendo sobre cada parámetro representa. A continuación se muestra un …

10 mixed-model  lme4-nlme 

Como contraparte de esta publicación , trabajé en la simulación de datos con variables continuas, prestándome a intercepciones y pendientes correlacionadas. Aunque hay excelentes publicaciones sobre este tema en el sitio y fuera del sitio , tuve dificultades para encontrar un ejemplo de principio a fin con datos simulados que …

10 regression  mixed-model  lme4-nlme 

En la lmerfunción dentro lme4de Rhay una llamada para la construcción de una matriz de modelo de efectos aleatorios, , como se explica aquí , páginas 7 - 9.ZZZ El cálculo de implica productos de KhatriRao y / o Kronecker de dos matrices, y . ZZZJyoJyoJ_iXyoXyoX_i La matriz es un …

10 r  mixed-model  lme4-nlme  matrix 

Estoy realizando pruebas post-hoc en un modelo lineal de efectos mixtos en R( lme4paquete). Estoy usando el multcomppaquete ( glht()función) para realizar las pruebas post-hoc. Mi diseño experimental es de medidas repetidas, con un efecto de bloqueo aleatorio. Los modelos se especifican como: mymod <- lmer(variable ~ treatment * time …

10 mixed-model  post-hoc  lsmeans  lme4-nlme 

Dadas tres variables, yy x, que son positivas continuas, y z, que es categórica, tengo dos modelos candidatos dados por: fit.me <- lmer( y ~ 1 + x + ( 1 + x | factor(z) ) ) y fit.fe <- lm( y ~ 1 + x ) Espero comparar estos …

10 r  hypothesis-testing  mixed-model  lme4-nlme 

Tengo el siguiente modelo m_plotequipado con lme4::lmerefectos aleatorios cruzados para los participantes ( lfdn) y los elementos ( content): Random effects: Groups Name Variance Std.Dev. Corr lfdn (Intercept) 172.173 13.121 role1 62.351 7.896 0.03 inference1 24.640 4.964 0.08 -0.30 inference2 52.366 7.236 -0.05 0.17 -0.83 inference3 21.295 4.615 -0.03 0.22 …

10 mixed-model  lme4-nlme  intraclass-correlation 

La fórmula que uno debe especificar para entrenar un modelo multinivel (usando lmerdesde la lme4 Rbiblioteca) siempre me da. He leído innumerables libros de texto y tutoriales, pero nunca lo he entendido correctamente. Así que aquí hay un ejemplo de este tutorial que me gustaría ver formulado en una ecuación. …

10 r  multilevel-analysis  lme4-nlme 

Estoy analizando los resultados de un experimento de tiempo de reacción en R. Ejecuté un ANOVA de medidas repetidas (1 factor dentro del sujeto con 2 niveles y 1 factor entre sujetos con 2 niveles). Ejecuté un modelo lineal mixto similar y quería resumir los resultados de lmer en forma …

10 anova  mixed-model  repeated-measures  lme4-nlme  degrees-of-freedom 

Por un simple ejemplo, suponga que hay dos modelos de regresión lineal Modelo 1 tiene tres predictores, x1a, x2b, yx2c El modelo 2 tiene tres predictores del modelo 1 y dos predictores adicionales x2ayx2b Hay una ecuación de regresión poblacional donde la varianza poblacional explicada es para el Modelo 1 …

10 regression  confidence-interval  estimation  r-squared  shrinkage  anova  t-test  references  tukey-hsd  machine-learning  boosting  r  clustering  fishers-exact  generalized-linear-model  model  probit  link-function  r  survival  probability  distributions  dice  logistic  lme4-nlme  glmm  meta-analysis  distributions  distributions  factor-analysis  r  anova  repeated-measures  post-hoc 

Estoy tratando de adaptar un modelo mixto multivariado (es decir, respuesta múltiple) R. Aparte de los paquetes ASReml-ry SabreR(que requieren software externo), parece que esto solo es posible en MCMCglmm. En el documento que acompaña al MCMCglmmpaquete (págs. 6), Jarrod Hadfield describe el proceso de ajustar un modelo como el …

10 r  mixed-model  multivariate-analysis  lme4-nlme  multivariate-regression