Preguntas etiquetadas con p-value

¿Cuán conservadora es la corrección de pruebas múltiples de Benjamini-Hochberg en relación con el número total de comparaciones? Por ejemplo, si tengo una lista de 18,000 funciones para dos grupos y realizo una prueba de Wilcoxon para obtener un valor p. Ajuste ese valor p usando Benjamini-Hochberg y casi nada …

19 multiple-comparisons  p-value 

Mi situación es la siguiente: quiero, a través de un estudio de Monte-Carlo, comparar los valores de dos pruebas diferentes para la significación estadística de un parámetro estimado (nulo es "sin efecto, el parámetro es cero", y la alternativa implícita es " el parámetro no es cero "). La prueba …

18 hypothesis-testing  p-value 

¿Por qué los estadísticos nos desalientan de referirnos a los resultados como " altamente significativos" cuando el valor está muy por debajo del nivel α convencional de 0.05 ?pppαα\alpha0.050.050.05 ¿Es realmente incorrecto confiar en un resultado que tiene una probabilidad del 99.9% de no ser un error Tipo I ( …

18 hypothesis-testing  statistical-significance  p-value  terminology 

Parece que me he confundido tratando de entender si un valor de rrr cuadrado también tiene un valor de ppp . Según tengo entendido, en la correlación lineal con un conjunto de puntos de datos, puede tener un valor que varía de a y este valor, cualquiera que sea, puede …

18 statistical-significance  p-value  r-squared 

No me refiero a un valor cercano a cero (redondeado a cero por algún software estadístico) sino a un valor literalmente cero. Si es así, ¿significaría que la probabilidad de obtener los datos obtenidos suponiendo que la hipótesis nula es verdadera también es cero? ¿Cuáles son (algunos ejemplos) de pruebas …

17 hypothesis-testing  statistical-significance  p-value 

Escuché que bajo la hipótesis nula, la distribución del valor p debería ser uniforme. Sin embargo, las simulaciones de la prueba binomial en MATLAB devuelven distribuciones muy diferentes de las uniformes con una media mayor que 0.5 (0.518 en este caso): coin = [0 1]; success_vec = nan(20000,1); for i …

17 matlab  p-value  binomial  simulation  uniform 

tl; dr: para la regresión OLS, ¿un R cuadrado más alto también implica un valor P más alto? Específicamente para una sola variable explicativa (Y = a + bX + e) ​​pero también estaría interesado en saber para n múltiples variables explicativas (Y = a + b1X + ... bnX …

17 regression  modeling  p-value  r-squared 

Estoy tratando de entender el reclamo general realizado en Taleb, 2016, The Meta-Distribution of Standard P-Values . En él, Taleb hace el siguiente argumento a favor de la falta de fiabilidad del valor p (según tengo entendido): Un procedimiento de estimación que opera en puntos de datos provenientes de alguna …

16 hypothesis-testing  statistical-significance  p-value 

Así que he estado leyendo mucho sobre cómo interpretar correctamente un valor P, y de lo que he leído, el valor p no dice NADA sobre la probabilidad de que la hipótesis nula sea verdadera o falsa. Sin embargo, al leer la siguiente declaración: El valor p representa la probabilidad …

16 hypothesis-testing  p-value 

Estoy buscando varias formas de explicar a mis alumnos (en un curso de estadística elemental) qué es una prueba de dos colas y cómo se calcula su valor P. ¿Cómo les explica a sus estudiantes el examen de dos contra uno?

16 hypothesis-testing  p-value  teaching 

Estoy experimentando con el algoritmo de la máquina de aumento de gradiente a través del caretpaquete en R. Usando un pequeño conjunto de datos de admisión a la universidad, ejecuté el siguiente código: library(caret) ### Load admissions dataset. ### mydata <- read.csv("http://www.ats.ucla.edu/stat/data/binary.csv") ### Create yes/no levels for admission. ### mydata$admit_factor[mydata$admit==0] …

15 machine-learning  caret  boosting  gbm  hypothesis-testing  t-test  panel-data  psychometrics  intraclass-correlation  generalized-linear-model  categorical-data  binomial  model  intercept  causality  cross-correlation  distributions  ranks  p-value  z-test  sign-test  time-series  references  terminology  cross-correlation  definition  probability  distributions  beta-distribution  inverse-gamma  missing-data  paired-comparisons  paired-data  clustered-standard-errors  cluster-sample  time-series  arima  logistic  binary-data  odds-ratio  medicine  hypothesis-testing  wilcoxon-mann-whitney  unsupervised-learning  hierarchical-clustering  neural-networks  train  clustering  k-means  regression  ordinal-data  change-scores  machine-learning  experiment-design  roc  precision-recall  auc  stata  multilevel-analysis  regression  fitting  nonlinear  jmp  r  data-visualization  gam  gamm4  r  lme4-nlme  many-categories  regression  causality  instrumental-variables  endogeneity  controlling-for-a-variable 

Un revisor nos pidió que proporcionáramos valores p para comprender mejor las estimaciones del modelo en nuestro modelo bayesiano multinivel. El modelo es un modelo típico de múltiples observaciones por participante en un experimento. Estimamos el modelo con Stan, por lo que podemos calcular fácilmente estadísticas posteriores adicionales. Actualmente, estamos …

15 bayesian  p-value  multilevel-analysis 

Tengo dos conjuntos de datos y me gustaría saber si son significativamente diferentes o no (esto proviene de "¿ Dos grupos son significativamente diferentes? Prueba de uso "). Decidí usar una prueba de permutación, haciendo lo siguiente en R: permutation.test <- function(coding, lncrna) { coding <- coding[,1] # dataset1 lncrna …

15 p-value  permutation-test 

Las pruebas de permutación (también llamadas prueba de aleatorización, prueba de aleatorización o prueba exacta) son muy útiles y resultan útiles cuando t-testno se cumple el supuesto de distribución normal requerido por ejemplo y cuando se transforman los valores mediante la clasificación de prueba no paramétrica como Mann-Whitney-U-testconduciría a la …

15 hypothesis-testing  permutation-test  exchangeability  r  statistical-significance  loess  data-visualization  normal-distribution  pdf  ggplot2  kernel-smoothing  probability  self-study  expected-value  normal-distribution  prior  correlation  time-series  regression  heteroscedasticity  estimation  estimators  fisher-information  data-visualization  repeated-measures  binary-data  panel-data  mathematical-statistics  coefficient-of-variation  normal-distribution  order-statistics  regression  machine-learning  one-class  probability  estimators  forecasting  prediction  validation  finance  measurement-error  variance  mean  spatial  monte-carlo  data-visualization  boxplot  sampling  uniform  chi-squared  goodness-of-fit  probability  mixture  theory  gaussian-mixture  regression  statistical-significance  p-value  bootstrap  regression  multicollinearity  correlation  r  poisson-distribution  survival  regression  categorical-data  ordinal-data  ordered-logit  regression  interaction  time-series  machine-learning  forecasting  cross-validation  binomial  multiple-comparisons  simulation  false-discovery-rate  r  clustering  frequency  wilcoxon-mann-whitney  wilcoxon-signed-rank  r  svm  t-test  missing-data  excel  r  numerical-integration  r  random-variable  lme4-nlme  mixed-model  weighted-regression  power-law  errors-in-variables  machine-learning  classification  entropy  information-theory  mutual-information 

Se pone mucho énfasis en confiar e informar los tamaños de los efectos en lugar de los valores p en la investigación aplicada (por ejemplo, citas más abajo). Pero, ¿no es cierto que un tamaño de efecto como un valor p es una variable aleatoria y, como tal, puede variar …

14 hypothesis-testing  confidence-interval  p-value  effect-size