Preguntas etiquetadas con mixed-model

Actualmente estoy usando el paquete R lme4 . Estoy usando modelos de efectos lineales mixtos con efectos aleatorios: library(lme4) mod1 <- lmer(r1 ~ (1 | site), data = sample_set) #Only random effects mod2 <- lmer(r1 ~ p1 + (1 | site), data = sample_set) #One fixed effect + # random …

37 r  regression  mixed-model  random-effects-model 

EffectsEl paquete proporciona una manera muy rápida y conveniente de graficar los resultados del modelo de efectos mixtos lineales obtenidos a través delme4 paquete . La effectfunción calcula los intervalos de confianza (IC) muy rápidamente, pero ¿qué tan confiables son estos intervalos de confianza? Por ejemplo: library(lme4) library(effects) library(ggplot) data(Pastes) …

36 r  mixed-model  confidence-interval  effects  lme4-nlme 

¿En qué condiciones debería alguien considerar el uso de análisis multinivel / jerárquico en lugar de análisis más básicos / tradicionales (por ejemplo, ANOVA, regresión OLS, etc.)? ¿Hay alguna situación en la que esto pueda considerarse obligatorio? ¿Hay situaciones en las que el uso de análisis multinivel / jerárquico es …

36 mixed-model  multilevel-analysis 

Recientemente me di cuenta de que un modelo mixto con solo sujeto como factor aleatorio y los otros factores como factores fijos es equivalente a un ANOVA cuando se establece la estructura correlacional del modelo mixto en simetría compuesta. Por lo tanto, me gustaría saber qué significa la simetría compuesta …

35 correlation  anova  mixed-model  lme4-nlme 

Tengo datos recopilados de un experimento organizado de la siguiente manera: Dos sitios, cada uno con 30 árboles. 15 son tratados, 15 son control en cada sitio. De cada árbol, tomamos muestras de tres piezas del tallo y tres piezas de las raíces, por lo que 6 muestras de nivel …

34 r  mixed-model  model  nested-data  lme4-nlme 

Estoy tratando de entender cuándo usar un efecto aleatorio y cuándo es innecesario. Me han dicho que una regla de oro es si tienes 4 o más grupos / individuos que yo hago (15 alces individuales). Algunos de esos alces fueron experimentados 2 o 3 veces para un total de …

34 mixed-model  lme4-nlme  random-effects-model  glmm 

Me pregunto cuáles son las diferencias entre GLM mixtos y no mezclados. Por ejemplo, en SPSS, el menú desplegable permite a los usuarios ajustar: analyze-> generalized linear models-> generalized linear models Y analyze-> mixed models-> generalized linear ¿Tratan los valores perdidos de manera diferente? Mi variable dependiente es binaria y …

34 mixed-model  generalized-linear-model  glmm  gee 

Queridos todos, he notado algo extraño que no puedo explicar, ¿verdad? En resumen: el enfoque manual para calcular un intervalo de confianza en un modelo de regresión logística y la función R confint()dan resultados diferentes. He estado pasando por la regresión logística aplicada de Hosmer & Lemeshow (2a edición). En …

34 r  regression  logistic  confidence-interval  profile-likelihood  correlation  mcmc  error  mixture  measurement  data-augmentation  r  logistic  goodness-of-fit  r  time-series  exponential  descriptive-statistics  average  expected-value  data-visualization  anova  teaching  hypothesis-testing  multivariate-analysis  r  r  mixed-model  clustering  categorical-data  unsupervised-learning  r  logistic  anova  binomial  estimation  variance  expected-value  r  r  anova  mixed-model  multiple-comparisons  repeated-measures  project-management  r  poisson-distribution  control-chart  project-management  regression  residuals  r  distributions  data-visualization  r  unbiased-estimator  kurtosis  expected-value  regression  spss  meta-analysis  r  censoring  regression  classification  data-mining  mixture 

Tengo un modelo de efectos mixtos (de hecho, un modelo mixto aditivo generalizado) que me da predicciones para una serie temporal. Para contrarrestar la autocorrelación, utilizo un modelo corCAR1, dado que me faltan datos. Se supone que los datos me dan una carga total, por lo que necesito sumar todo …

32 mixed-model  variance  random-variable 

Quiero ajustar un GLMM multinivel con una distribución de Poisson (con sobredispersión) usando R. En este momento estoy usando lme4 pero noté que recientemente la quasipoissonfamilia fue eliminada. He visto en otras partes que puede modelar la sobredispersión aditiva para distribuciones binomiales agregando una intercepción aleatoria con un nivel por …

32 r  mixed-model  poisson-distribution  lme4-nlme  overdispersion 

Estoy tratando de analizar algunos datos usando un modelo de efectos mixtos. Los datos que recopilé representan el peso de algunos animales jóvenes de diferentes genotipos a lo largo del tiempo. Estoy usando el enfoque propuesto aquí: https://gribblelab.wordpress.com/2009/03/09/repeated-measures-anova-using-r/ En particular estoy usando la solución # 2 Entonces tengo algo como …

31 r  anova  mixed-model  multiple-comparisons  repeated-measures 

Con suerte, esta es una pregunta que alguien aquí puede responder por mí sobre la naturaleza de la descomposición de sumas de cuadrados a partir de un modelo de efectos mixtos lmer(del paquete lme4 R). En primer lugar, debo decir que soy consciente de la controversia con el uso de …

30 r  anova  mixed-model  lme4-nlme 

Me preguntaba si alguien podría iluminarme sobre las diferencias actuales entre estas dos funciones. Encontré la siguiente pregunta: ¿Cómo elegir la biblioteca nlme o lme4 R para modelos de efectos mixtos? , pero eso data de hace un par de años. Eso es toda una vida en los círculos de …

30 r  mixed-model  lme4-nlme 

Me gustaría obtener un valor p y un tamaño de efecto de una variable categórica independiente (con varios niveles), que es "general" y no para cada nivel por separado, como es la salida normal de lme4R. Es igual que lo que la gente informa cuando ejecuta un ANOVA. ¿Cómo puedo …

28 r  hypothesis-testing  anova  mixed-model  lme4-nlme 

Espero que no les importe esta pregunta, pero necesito ayuda para interpretar el resultado de un resultado de modelo de efectos mixtos lineales que he tratado de aprender a hacer en R. Soy nuevo en el análisis de datos longitudinales y la regresión de efectos mixtos lineales. Tengo un modelo …

28 r  mixed-model  interpretation  panel-data