Preguntas etiquetadas con r

Lo siento si esta es una pregunta nueva; Estoy tratando de enseñarme estadísticas por primera vez. Creo que tengo el procedimiento básico, pero estoy luchando para ejecutarlo con R. Entonces, estoy tratando de evaluar la importancia de los coeficientes de regresión en una regresión lineal múltiple de forma y^= Xβ^y^=Xβ^ …

13 r  statistical-significance  multiple-regression 

Espero que alguien en estos foros pueda ayudarme con este problema básico en los estudios de expresión génica. Hice una secuenciación profunda de un tejido experimental y uno de control. Luego obtuve valores de enriquecimiento doble de genes en la muestra experimental sobre el control. El genoma de referencia tiene …

13 r  genetics  bioinformatics  microarray  biostatistics 

En el siguiente ejemplo > m = matrix(c(3, 6, 5, 6), nrow=2) > m [,1] [,2] [1,] 3 5 [2,] 6 6 > (OR = (3/6)/(5/6)) #1 [1] 0.6 > fisher.test(m) #2 Fisher's Exact Test for Count Data data: m p-value = 0.6699 alternative hypothesis: true odds ratio is not …

13 r  odds-ratio  fishers-exact 

Estoy tratando de interpretar la salida de nls (). He leído esta publicación pero aún no entiendo cómo elegir la mejor opción. De mis ajustes tengo dos salidas: > summary(m) Formula: y ~ I(a * x^b) Parameters: Estimate Std. Error t value Pr(>|t|) a 479.92903 62.96371 7.622 0.000618 *** b …

12 r  least-squares  nonlinear-regression  goodness-of-fit 

En un artículo reciente, Norton et al. (2018) declara que[ 1 ][1]^{[1]} No se pueden comparar diferentes razones de probabilidad del mismo estudio cuando los modelos estadísticos que dan como resultado estimaciones de razón de probabilidades tienen diferentes variables explicativas porque cada modelo tiene un factor de escala arbitrario diferente. …

12 r  logistic  meta-analysis  odds-ratio  adjustment 

El siguiente problema ha sido publicado en la página de Facebook de Mensa International: \quad\quad\quad\quad\quad\quad\quad\quad La publicación en sí recibió más de 1000 comentarios, pero no entraré en detalles sobre el debate allí, ya que sé que esta es la paradoja de Bertrand y la respuesta es . Lo que …

12 r  probability  simulation  monte-carlo  paradox 

He estado explorando una serie de herramientas para pronosticar, y he encontrado que los Modelos Aditivos Generalizados (GAM) tienen el mayor potencial para este propósito. ¡Los GAM son geniales! Permiten especificar modelos complejos de manera muy sucinta. Sin embargo, esa misma brevedad me está causando cierta confusión, específicamente con respecto …

12 r  modeling  gam  mgcv 

En R, tengo una muestra de 348 medidas, y quiero saber si puedo asumir que normalmente se distribuye para futuras pruebas. Básicamente, siguiendo otra respuesta de Stack , estoy mirando el gráfico de densidad y el gráfico QQ con: plot(density(Clinical$cancer_age)) qqnorm(Clinical$cancer_age);qqline(Clinical$cancer_age, col = 2) No tengo una gran experiencia en …

12 r  normal-distribution 

Los polinomios ortogonales en un conjunto univariado de puntos son polinomios que producen valores en esos puntos de manera que su producto escalar y su correlación por pares son cero. R puede producir polinomios ortogonales con función poli . La misma función tiene un polimero variante que produce polinomios ortogonales …

12 r  multiple-regression  polynomial  orthogonal 

Me gustaría obtener intervalos de confianza del 95% en las predicciones de un nlmemodelo mixto no lineal . Como no se proporciona nada estándar para hacer esto dentro nlme, me preguntaba si es correcto usar el método de "intervalos de predicción de población", como se describe en el capítulo del …

12 r  mixed-model  confidence-interval  lme4-nlme 

He estado usando modelos lineales para realizar pruebas de proporción de 2 muestras durante un tiempo, pero me di cuenta de que podría no ser completamente correcto. Parece que el uso de un modelo lineal generalizado con un vínculo binomial familia + identidad proporciona exactamente los resultados de la prueba …

12 r  hypothesis-testing  generalized-linear-model  proportion 

Por ejemplo, en R si llama a la acf()función, traza un correlograma de forma predeterminada y dibuja un intervalo de confianza del 95%. Mirando el código, si llama plot(acf_object, ci.type="white"), verá: qnorm((1 + ci)/2)/sqrt(x$n.used) como límite superior para el tipo de ruido blanco. ¿Alguien puede explicar la teoría detrás de …

12 r  confidence-interval  autocorrelation 

Estoy tratando de descubrir cómo detectar la cantidad de sílabas en un corpus de grabaciones de audio. Creo que un buen proxy podría ser picos en el archivo de onda. Esto es lo que probé con un archivo de mí hablando en inglés (mi caso de uso real está en …

12 r  signal-processing 

Hice mediciones de dos variables e . Ambos tienen incertidumbres conocidas y asociadas con ellos. Quiero encontrar la relación entre e . ¿Cómo puedo hacerlo?x y σ x σ y x ynortennXxxyyyσXσx\sigma_xσyσy\sigma_yXxxyyy EDITAR : cada tiene una asociada a ella, y lo mismo con la .σ x , i y …

12 r  regression  deming-regression 

Pensé que entendía este problema, pero ahora no estoy tan seguro y me gustaría consultar con otros antes de continuar. Tengo dos variables Xy Y. Yes una relación, y no está limitada por 0 y 1 y generalmente se distribuye normalmente. Xes una proporción y está delimitada por 0 y …

12 r  regression  data-transformation  nonlinear-regression  proportion