Preguntas etiquetadas con efficiency

Tengo que resolver varios problemas desafiantes de optimización global no convexo. Actualmente uso la Caja de herramientas de optimización de MATLAB (específicamente, fmincon()con algoritmo = 'sqp'), que es bastante eficaz . Sin embargo, la mayor parte de mi código está en Python, y me encantaría hacer la optimización también en …

77 python  optimization  nonlinear-programming  linear-algebra  linear-solver  sparse-matrix  ode  automatic-differentiation  efficiency  matrix  symbolic-computation  pde  multiphysics  operator-splitting  fluid-dynamics  pde  multigrid  pde  hyperbolic-pde  quadrature  precision  numerical-analysis  fluid-dynamics  interpolation  c  ode  testing  data-sets  pde  fluid-dynamics  hyperbolic-pde  pde  finite-element  fluid-dynamics  stability  incompressible  pde  hyperbolic-pde  fluid-dynamics  pde  precision  floating-point  convex-optimization  conditioning  pde  hyperbolic-pde  stability  implicit-methods  explicit-methods  fluid-dynamics  accuracy  pde  hyperbolic-pde  petsc  linear-algebra 

Uno de los principales problemas con los que tenemos que lidiar en las simulaciones moleculares es el cálculo de las fuerzas dependientes de la distancia. Si podemos restringir las funciones de fuerza y ​​distancia para tener potencias iguales de la distancia de separación , entonces podemos calcular el cuadrado de …

26 efficiency 

Estoy ejecutando simulaciones de dinámica molecular (MD) usando varios paquetes de software, como Gromacs y DL_POLY. Gromacs ahora admite los algoritmos de descomposición de partículas y de descomposición de dominio. Por defecto, las simulaciones de Gromacs utilizan la descomposición de dominio, aunque durante muchos años, hasta hace poco, la descomposición …

15 parallel-computing  efficiency  molecular-dynamics  simulation 

Mi grupo de investigación se centra en la dinámica molecular, que obviamente puede generar gigabytes de datos como parte de una sola trayectoria que luego debe analizarse. Varios de los problemas que nos preocupan implican correlaciones en el conjunto de datos, lo que significa que necesitamos hacer un seguimiento de …

15 python  c  efficiency 

He leído que si, por ejemplo, tengo un forbucle doble que se ejecuta sobre los índices de una matriz, entonces poner el índice de ejecución de la columna en el bucle externo es más eficiente. Por ejemplo: a=zeros(1000); for j=1:1000 for i=1:1000 a(i,j)=1; end end ¿Cuál es la forma más …

12 matlab  efficiency 

Estoy interesado en establecer cálculos para verificar si se cumple un criterio de distancia: es decir, la distancia entre un vector y otro vector x j debería ser menor que algún valor r m a x . Mis datos se dividen de acuerdo con una cuadrícula de coordenadas ortogonal. Dado …

12 efficiency 

La diferenciación automática nos permite evaluar numéricamente la derivada de un programa en una entrada particular. Existe un teorema de que este cálculo puede realizarse a un costo inferior a cinco veces el costo para ejecutar el programa original. Este factor de cinco es un límite superior. ¿En qué situaciones …

12 automatic-differentiation  efficiency 

Cerrado. Esta pregunta está fuera de tema . Actualmente no está aceptando respuestas. ¿Quieres mejorar esta pregunta? Actualice la pregunta para que sea sobre el tema de Computational Science Stack Exchange. Cerrado hace 5 años . ¿Existe un grado de complejidad mayor que O(n)O(n)O(n) y menor que O(nlogn)O(nlog⁡n)O(n \log n) …

10 algorithms  complexity  efficiency 

Estoy tratando de entender la diferencia entre estas dos tarjetas gráficas para la informática académica, específicamente para el componente DGEMM. Si miramos las estadísticas en bruto, ambas tienen el mismo chip GK110, tienen estadísticas comparables en prácticamente todas las categorías y, creo, tienen la misma arquitectura central. Antes de cualquier …

10 performance  gpu  efficiency 

¿Cuál es la forma más moderna de implementar funciones especiales de doble precisión? Necesito la siguiente integral: Fmetro( t ) =∫10 0tu2 mmi- tu2du =γ( m + 12, t )2 tm + 12Fmetro(t)=∫0 01tu2metromi-ttu2retu=γ(metro+12,t)2tmetro+12 F_m(t) = \int_0^1 u^{2m} e^{-tu^2} d u = {\gamma(m+{1\over 2}, t)\over 2 t^{m+{1\over 2}}} param = …

10 efficiency  accuracy  special-functions