Preguntas etiquetadas con r

Me gustaría encontrar una manera de cuantificar la intensidad de la bimodalidad de algunas distribuciones que obtuve empíricamente. Por lo que leí, todavía hay cierto debate sobre la forma de cuantificar la bimodalidad. Elegí usar la prueba de inmersión de Hartigans, que parece ser la única disponible en R (documento …

18 r  distributions 

Estoy usando K-means para agrupar mis datos y estaba buscando una manera de sugerir un número de clúster "óptimo". Las estadísticas de brecha parecen ser una forma común de encontrar un buen número de clúster. Por alguna razón, devuelve 1 como número de clúster óptimo, pero cuando miro los datos …

18 r  machine-learning  clustering  k-means 

Me gustaría detectar cambios en los datos de series temporales, que generalmente tienen la misma forma. Hasta ahora he trabajado con el changepointpaquete para R y las funciones cpt.mean(), cpt.var()y cpt.meanvar(). cpt.mean()con el método PELT funciona bien cuando los datos generalmente se mantienen en un nivel. Sin embargo, también me …

18 r  time-series  change-point  structural-change 

Supongamos que tengo datos con dos grupos independientes: g1.lengths <- c (112.64, 97.10, 84.18, 106.96, 98.42, 101.66) g2.lengths <- c (84.44, 82.10, 83.26, 81.02, 81.86, 86.80, 85.84, 97.08, 79.64, 83.32, 91.04, 85.92, 73.52, 85.58, 97.70, 89.72, 88.92, 103.72, 105.02, 99.48, 89.50, 81.74) group = rep (c ("g1", "g2"), c (length …

18 r  hypothesis-testing  bootstrap  small-sample  permutation-test 

Algunos de ustedes podrían haber leído este bonito artículo: O'Hara RB, Kotze DJ (2010) No log-transforma los datos de recuento. Methods in Ecology and Evolution 1: 118–122. Klick . En mi campo de investigación (ecotoxicología) estamos lidiando con experimentos pobremente replicados y los GLM no son ampliamente utilizados. Entonces hice …

18 r  generalized-linear-model  simulation  negative-binomial  type-i-and-ii-errors 

Cerrado. Esta pregunta está fuera de tema . Actualmente no está aceptando respuestas. ¿Quieres mejorar esta pregunta? Actualice la pregunta para que sea sobre el tema de Cross Validated. Cerrado hace 5 años . Estoy tratando de compilar una lista de algoritmos de agrupamiento que son: Implementado en R Opere …

18 r  clustering  sparse 

Para hacer este gráfico, generé muestras aleatorias de diferente tamaño a partir de una distribución normal con media = 0 y sd = 1. Los intervalos de confianza se calcularon utilizando valores de corte alfa que van desde .001 a .999 (línea roja) con la función t.test (), la probabilidad …

18 r  confidence-interval  profile-likelihood 

Quiero realizar una regresión lineal muy simple en R. La fórmula es tan simple como . Sin embargo, me gustaría que la pendiente ( ) esté dentro de un intervalo, digamos, entre 1.4 y 1.6.y= a x + by=unX+siy = ax + bununa ¿Cómo se puede hacer esto?

18 r  regression  constrained-regression 

Sé que una de las ventajas de los modelos mixtos es que permiten especificar la matriz de varianza-covarianza para los datos (simetría compuesta, autorregresiva, no estructurada, etc.) Sin embargo, la lmerfunción en R no permite una fácil especificación de esta matriz. ¿Alguien sabe qué estructura lmerusa por defecto y por …

18 r  mixed-model  lme4-nlme  covariance-matrix 

¿La implementación de ER es más eficiente Extreme Gradient Boosting? Hay un paquete R que los implementa. ¿Es un nuevo algoritmo que supera la implementación "genérica" ​​(paquete RandomForest de R) no solo en términos de eficiencia o también en algunas otras áreas? Bosque aleatorio extremo http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10994-006-6226-1

18 r  machine-learning  algorithms  random-forest 

Necesito calcular la muestra de la distancia de Mahalanobis en R entre cada par de observaciones en una matriz de covariables . Necesito una solución que sea eficiente, es decir, solo se calculan distancias, y preferiblemente se implementa en C / RCpp / Fortran, etc. Asumo que , la matriz …

18 r  algorithms  distance 

He estado usando SAS profesionalmente durante casi 5 años. Lo tengo instalado en mi computadora portátil y con frecuencia tengo que analizar conjuntos de datos con 1,000-2,000 variables y cientos de miles de observaciones. He estado buscando alternativas a SAS que me permitan realizar análisis en conjuntos de datos de …

18 r  sas  large-data 

¿Cuál es el valor dado en el resumen de un modelo coxph en R? Por ejemplo,R2R2R^2 Rsquare= 0.186 (max possible= 0.991 ) Lo incluí tontamente como un manuscrito como un valor y el revisor saltó sobre él diciendo que no estaba al tanto de un análogo del estadístico R ^ …

18 r  survival  r-squared  cox-model 

Planeo hacer un estudio de simulación donde comparo el desempeño de varias técnicas de correlación robustas con diferentes distribuciones (sesgadas, con valores atípicos, etc.). Con robusto , me refiero al caso ideal de ser robusto contra a) distribuciones sesgadas, b) valores atípicos yc) colas pesadas. Junto con la correlación de …

18 r  correlation  robust  spearman-rho  winsorizing 

En particular, ¿cómo deben calcularse los errores estándar de los efectos fijos en un modelo lineal de efectos mixtos (en un sentido frecuentista)? He estado llevan a creer que las estimaciones típicas ( Var(β^)=(X′VX)−1Var(β^)=(X′VX)−1{\rm Var}(\hat\beta)=(X'VX)^{-1} ), tales como los presentados en Laird y Ware [1982] darán SE de que se …

18 r  mixed-model  random-effects-model