Preguntas etiquetadas con python

Soy nuevo en programación y estoy tratando de resolver mi primer gran problema y escribir mi primer gran programa. He buscado ejemplos de código abierto de código para aprender, pero hasta ahora solo he encontrado código en idiomas que no entiendo completamente o que hace cosas relacionadas pero aún muy …

12 computational-chemistry  python  visualization 

La esencia de mi pregunta es la siguiente: tengo un sistema de dos EDO. Uno tiene una restricción de valor inicial y el otro tiene una restricción de valor final. Esto puede considerarse como un sistema único con una restricción de valor inicial en algunas variables y una restricción de …

12 python  ode  boundary-conditions 

Tengo que escribir un código de volumen finito para Magnetohidrodinámica (MHD). He escrito código numérico antes pero no a esta escala. Solo quería preguntar cuál sería una buena opción, usando una estructura de datos (enfoque orientado a objetos) con clases o simplemente usando múltiples matrices para diferentes propiedades, en términos …

11 python  finite-volume  data-structures 

Tengo un conjunto de datos de puntos tridimensionales para los que me gustaría construir una malla, usando python. Todo el software que he visto requiere que proporciones los bordes. ¿Hay un programa en Python que toma como entrada un conjunto de puntos en 3D y genera una malla? Si es …

11 python  mesh-generation 

Tengo un problema físico regido por la ecuación de Poisson en dos dimensiones Tengo mediciones de los dos componentes de gradiente ∂ u / ∂ x y ∂ u / ∂ y a lo largo de alguna parte del límite, Γ m , por lo que me gustaría imponer ∂ …

11 finite-element  python  fenics 

CVXOPT: http://abel.ee.ucla.edu/cvxopt/index.html OpenOpt: http://openopt.org/Welcome ¿Cuál es la relación entre ellos? ¿Cuáles son las ventajas / desventajas de ellos, respectivamente? Por cierto, ¿hay alguna otra biblioteca de optimización convexa de propósito general de alta calidad para Python / C ++ que valga la pena señalar?

11 python  convex-optimization 

Tengo experiencia en la codificación de OpenMP para máquinas de memoria compartida (tanto en C como en FORTRAN) para llevar a cabo tareas simples como la suma de matrices, la multiplicación, etc. (Solo para ver cómo compite con LAPACK). Conozco OpenMP lo suficiente como para llevar a cabo tareas simples …

11 parallel-computing  python 

¿Hay algún algoritmo para la detección comunitaria de gráficos bipartitos (redes de 2 modos) implementados en igraph, networkX, R o Python, etc.? En particular, ¿existe tal implementación en la cual uno podría restringir la detección de comunidades solo en uno de los dos modos?

11 python  graph-theory 

¿Cuánto más lento es petsc4py vs c / c ++ / fortran? Me doy cuenta de que dependerá significativamente del código que se ejecute, pero ¿qué pasa con algo simple como un producto de matriz de vectores?

11 petsc  python 

Enumere el paquete de Python (petsc4py, etc.) y los pocos solucionadores directos que admite. Una respuesta (community-wiki) por paquete, por favor.

11 python  linear-solver  sparse-matrix 

Estoy tratando de implementar el método Runge-Kutta de cuarto orden para resolver un ODE de primer orden en Python, es decir, . Entiendo cómo funciona el método, pero estoy tratando de escribir un algoritmo eficiente que minimice el número de veces quese calculaf(x,y)ya que esto es bastante costoso. Me han …

11 ode  python  explicit-methods 

Leí en alguna parte que Pandas se desarrolló por primera vez para el mundo financiero, al menos no especialmente para las ciencias naturales (física, biología, etc.), entonces, ¿hay algún paquete similar de Python de análisis de datos más "orientado a las ciencias naturales"? Acabo de comenzar a usar Pandas y …

11 python  data-analysis  data-management 

Tengo un conjunto de datos que está cambiando lentamente, y necesito hacer un seguimiento de los vectores propios / valores propios de su matriz de covarianza. He estado usando scipy.linalg.eigh, pero es demasiado costoso, y no usa el hecho de que ya tengo una descomposición que es solo un poco …

10 linear-algebra  optimization  python  eigenvalues 

En mi respuesta a una pregunta sobre MSE con respecto a una simulación de física hamiltoniana en 2D, he sugerido usar un integrador simpléctico de orden superior . Entonces pensé que podría ser una buena idea demostrar los efectos de diferentes pasos de tiempo en la precisión global de los …

10 python  time-integration 

Para la reducción del modelo, quiero calcular los vectores singulares izquierdos asociados a los - digamos 20 - valores singulares más grandes de una matriz , donde y . Desafortunadamente, mi matriz será densa sin ninguna estructura. N ≈ 10 6 k ≈ 10 3 AA∈RN,kA∈RN,kA \in \mathbb R^{N,k}N≈106N≈106N\approx 10^6k≈103k≈103k\approx …

10 linear-algebra  python  reference-request  numpy  svd