Ciencia computacional

Me preguntaba si existe un método rápido y eficiente para encontrar el número de no ceros de antemano por multiplicación de matrices escasa asumiendo ambas matrices están en formato CSC o RSE. Sé que hay uno en el paquete smmp, pero necesito algo que ya esté implementado en C o …

17 matrix  sparse-matrix 

Una reducción en paralelo supone que la operación correspondiente es asociativa. Esta suposición se viola para la adición de números de punto flotante. Puedes preguntar por qué me importa esto. Bueno, hace que los resultados sean menos reproducibles. Y empeora cuando el recocido simulado se usa para optimizar (o ajustar …

17 parallel-computing  reproducibility 

Estoy interesado en casos en los que el gradiente Conjugate funciona mucho mejor que el método GMRES. En general, CG es la opción preferible en muchos casos de SPD (simétrica-positiva-definida) porque requiere menos almacenamiento y el límite teórico en la tasa de convergencia para CG es el doble de ese …

17 linear-solver  conjugate-gradient  gmres 

El otro día, mi instructor de la dinámica de fluidos computacional estaba ausente y envió en su estudiante de doctorado a sustituirlo. En la conferencia que dio, que parecía indicar varias desventajas asociadas con diversos esquemas de discretización para simulaciones de flujo de fluidos: Diferencia Finita Método: Es difícil satisfacer …

17 fluid-dynamics 

Tengo un no-convexa función 2-D acotada, que me gustaría encontrar el mínimo de. La función es bastante suave. Evaluar es costoso. Un error aceptable es de aproximadamente 3% del dominio de la función en cada eje. He intentado ejecutar la implementación del algoritmo DIRECTO en la biblioteca NLOPT, pero no …

17 optimization 

Cuando los cálculos limitados de ancho de banda de memoria se llevan a cabo en entornos de memoria compartida (por ejemplo, roscado a través de OpenMP, Pthreads, o TBB), hay un dilema de cómo garantizar que la memoria se distribuye correctamente a través de física de la memoria, de tal …

17 performance  memory-management  multicore 

El lenguaje C ++ proporciona programación genérica y metaprogramación a través de plantillas. Estas técnicas han encontrado su camino en muchos paquetes de computación científica a gran escala (por ejemplo, MPQC , LAMMPS , CGAL , Trilinos ). Pero, ¿qué han contribuido realmente a la informática científica en un valor …

17 performance  c++  programming-paradigms 

Siempre calculo las cosas a mano, pero ahora mis camaradas se están poniendo desagradables y hacen muchos ejercicios repetitivos que implican simplemente conectar cosas como la expresión anterior. Estoy particularmente interesado en software de código abierto como Python o R para simplificar este tipo de ecuaciones. I intentado usar Wolfram …

17 education  symbolic-computation 

En la literatura sobre métodos numéricos, muchos trabajos de investigación consisten en una descripción de una nueva variación algorítmica, seguida de algunos problemas de prueba que comparan el nuevo método con uno o dos métodos existentes. Esto dificulta determinar Cómo funcionaría el nuevo método en otros problemas de interés Cómo …

17 pde  testing 

Estoy planeando usar multirredes para calcular algunos valores y vectores propios, y noté que PETSc tiene soporte de alto nivel para multirredes. La documentación de PETSc dice que esta parte de PETSc no debe usarse, ya que se reemplazará pronto. ¿Qué otras bibliotecas tienen soporte de alto nivel para multigrid, …

17 petsc  libraries  multigrid 

Considere un IVP para el sistema ODE , y ( x 0 ) = y 0 . Más comúnmente, este problema se considera rígido cuando la matriz de Jacobi ∂ fy′=f(x,y)y′=f(x,y)y'=f(x,y)y(x0)=y0y(x0)=y0y(x_0)=y_0tienedosvalores propios con gran parte real negativa y valores propios con parte real negativa muy pequeña (que considero sólo el …

17 ode  stiffness 

En los albores de OS X, parecía haber una gran cantidad de bullicio, al menos en el mundo Mac (no estaba cerca de la informática científica en ese momento) sobre Mac OS como plataforma para la informática científica y las aplicaciones de HPC. XGrid salió de la caja, Virginia Tech …

17 software  hpc 

El desarrollo de algoritmos científicos es un proceso altamente iterativo que a menudo implica cambiar muchos parámetros que querré variar, ya sea como parte de mi diseño experimental o como parte del ajuste del rendimiento del algoritmo. ¿Qué estrategias puedo tomar para estructurar estos parámetros para que pueda cambiarlos fácilmente …

17 algorithms  testing  programming-paradigms 

Mi tesis es sobre el desarrollo de métodos numéricos para la reducción del modelo en la combustión. Ejecuto mis métodos únicamente en la parte química de las simulaciones de combustión, y tengo muchos estudios de casos para simulaciones 0-D (sin flujo). Lo que me gustaría es ejecutar simulaciones que tengan …

17 pde  fluid-dynamics  software  parallel-computing 

Nuestro grupo de trabajo produce una aplicación de escritorio que simula el rendimiento energético del edificio. Es una aplicación .NET y cuando el usuario ejecuta muchas simulaciones, puede llevar mucho tiempo. Las simulaciones son totalmente paralelizables, y tenemos algunos recursos informáticos de HPC muy significativos en "la oficina". Una idea …

17 hpc  partitioning