Preguntas etiquetadas con r

/ edit: Seguimiento adicional ahora puedes usar irlba :: prcomp_irlba / edit: siguiendo mi propio post. irlbaahora tiene argumentos de "centro" y "escala", que le permiten usarlo para calcular componentes principales, por ejemplo: pc <- M %*% irlba(M, nv=5, nu=0, center=colMeans(M), right_only=TRUE)$v Tengo una gran variedad Matrixde características que me …

31 r  pca  dimensionality-reduction  svd  matrix-decomposition 

Quiero generar la trama descrita en el libro ElemStatLearn "Los elementos del aprendizaje estadístico: minería de datos, inferencia y predicción. Segunda edición" de Trevor Hastie y Robert Tibshirani y Jerome Friedman. La trama es: Me pregunto cómo puedo producir este gráfico exacto R, especialmente tenga en cuenta los gráficos de …

31 r  data-visualization  k-nearest-neighbour 

¿Es posible visualizar el resultado del análisis de componentes principales de manera que proporcione más información que solo tablas de resumen? ¿Es posible hacerlo cuando el número de observaciones es grande, digamos ~ 1e4? ¿Y es posible hacerlo en R [otros entornos bienvenidos]?

31 r  data-visualization  pca  biplot 

He encontrado algunas distribuciones para las cuales BUGS y R tienen diferentes parametrizaciones: Normal, log-Normal y Weibull. Para cada uno de estos, deduzco que el segundo parámetro utilizado por R debe transformarse inversamente (1 / parámetro) antes de usarse en BUGS (o JAGS en mi caso). ¿Alguien sabe de una …

31 r  distributions  bugs  jags  parameterization 

Estoy tratando de analizar algunos datos usando un modelo de efectos mixtos. Los datos que recopilé representan el peso de algunos animales jóvenes de diferentes genotipos a lo largo del tiempo. Estoy usando el enfoque propuesto aquí: https://gribblelab.wordpress.com/2009/03/09/repeated-measures-anova-using-r/ En particular estoy usando la solución # 2 Entonces tengo algo como …

31 r  anova  mixed-model  multiple-comparisons  repeated-measures 

Contexto: en respuesta a una pregunta anterior sobre investigación reproducible, Jake escribió Un problema que descubrimos al crear nuestro archivo JASA fue que las versiones y los valores predeterminados de los paquetes CRAN cambiaron. Entonces, en ese archivo, también incluimos las versiones de los paquetes que utilizamos. El sistema basado …

31 r  reproducible-research  project-management 

Me gustaría determinar la importancia relativa de los conjuntos de variables para un randomForestmodelo de clasificación en R. La importancefunción proporciona la MeanDecreaseGinimétrica para cada predictor individual: ¿es tan simple como sumar esto en cada predictor de un conjunto? Por ejemplo: # Assumes df has variables a1, a2, b1, b2, …

31 r  machine-learning  classification  random-forest 

¿Es posible calcular los valores de AIC o BIC para los modelos de regresión de lazo y otros modelos regularizados donde los parámetros solo ingresan parcialmente la ecuación? ¿Cómo se determinan los grados de libertad? Estoy usando R para ajustar los modelos de regresión de lazo con la glmnet()función del …

31 r  model-selection  lasso  aic  bic 

Estoy tratando de graficar el número de acciones de los usuarios (en este caso, "me gusta") a lo largo del tiempo. Así que tengo "Número de acciones" como mi eje y, mi eje x es el tiempo (semanas) y cada línea representa un usuario. Mi problema es que quiero ver …

31 r  data-visualization 

Creo que R puede tomar mucho tiempo generar gráficos cuando hay millones de puntos presentes, lo que no es sorprendente dado que los puntos se trazan individualmente. Además, tales tramas a menudo son demasiado desordenadas y densas para ser útiles. Muchos de los puntos se superponen y forman una masa …

31 r  data-visualization 

Espero que alguien pueda proporcionar una visión general intuitiva de qué es la distribución cuasibinomial y qué hace. Estoy particularmente interesado en estos puntos: Cómo el cuasibinomio difiere de la distribución binomial. Cuando la variable de respuesta es una proporción (los valores de ejemplo incluyen 0.23, 0.11, 0.78, 0.98), un …

30 r  generalized-linear-model  binomial  overdispersion  quasi-likelihood 

Con suerte, esta es una pregunta que alguien aquí puede responder por mí sobre la naturaleza de la descomposición de sumas de cuadrados a partir de un modelo de efectos mixtos lmer(del paquete lme4 R). En primer lugar, debo decir que soy consciente de la controversia con el uso de …

30 r  anova  mixed-model  lme4-nlme 

Me preguntaba si alguien podría iluminarme sobre las diferencias actuales entre estas dos funciones. Encontré la siguiente pregunta: ¿Cómo elegir la biblioteca nlme o lme4 R para modelos de efectos mixtos? , pero eso data de hace un par de años. Eso es toda una vida en los círculos de …

30 r  mixed-model  lme4-nlme 

Me pregunto si hay alguna prueba estadística para "probar" la importancia de una distribución bimodal. Quiero decir, ¿cuánto cumplen mis datos con la distribución bimodal o no? Si es así, ¿hay alguna prueba en el programa R?

30 r  hypothesis-testing  distributions  bimodal 

Tengo un gran conjunto de datos y quiero realizar una reducción de dimensionalidad. Ahora, en todas partes, leo que puedo usar PCA para esto. Sin embargo, todavía parece que no sé qué hacer después de calcular / realizar el PCA. En R esto se hace fácilmente con el comando princomp. …

30 r  pca