Preguntas etiquetadas con lme4-nlme

Cerrado. Esta pregunta está fuera de tema . Actualmente no está aceptando respuestas. ¿Quieres mejorar esta pregunta? Actualice la pregunta para que esté en el tema de Cross Validated. Cerrado hace 6 meses . Estaba trabajando en los paquetes R nlme y lme4 , tratando de especificar los modelos con …

25 r  random-effects-model  lme4-nlme 

Estoy tratando de pasar de usar el ezpaquete a lmeANOVA para medidas repetidas (ya que espero poder usar contrastes personalizados con lme). Siguiendo el consejo de esta publicación de blog , pude configurar el mismo modelo usando ambos aov(como lo hace ez, cuando se solicitó) y lme. Sin embargo, mientras …

24 r  anova  mixed-model  repeated-measures  lme4-nlme 

He estado revisando esta descripción general de las fórmulas lm / lmer R de @conjugateprior y la siguiente entrada me ha confundido: Ahora suponga que A es aleatorio, pero B es fijo y B está anidado dentro de A. aov(Y ~ B + Error(A/B), data=d) A continuación, lmer(Y ~ B …

23 r  anova  mixed-model  repeated-measures  lme4-nlme 

Me pregunto si hay algún método para calcular el tamaño de la muestra en modelos mixtos. Estoy usando lmerR para ajustar los modelos (tengo pendientes e intercepciones aleatorias).

23 r  mixed-model  lme4-nlme  power-analysis 

Hemos ejecutado una regresión logística de efectos mixtos utilizando la siguiente sintaxis; # fit model fm0 <- glmer(GoalEncoding ~ 1 + Group + (1|Subject) + (1|Item), exp0, family = binomial(link="logit")) # model output summary(fm0) Sujeto y elemento son los efectos aleatorios. Estamos obteniendo un resultado impar, que es el coeficiente …

22 r  mixed-model  stata  glmm  lme4-nlme 

Supongamos que tengo alguna medida para cada sujeto en cada sitio. Dos variables, sujeto y sitio, son de interés en términos de cálculo de valores de correlación intraclase (ICC). Normalmente, usaría la función lmerdel paquete R lme4y ejecutaría lmer(measurement ~ 1 + (1 | subject) + (1 | site), mydata) …

22 r  lme4-nlme  intraclass-correlation 

Tengo un experimento de medidas repetidas donde la variable dependiente es un porcentaje, y tengo múltiples factores como variables independientes. Me gustaría usar glmerel paquete R lme4para tratarlo como un problema de regresión logística (especificando family=binomial) ya que parece acomodar esta configuración directamente. Mis datos se ven así: > head(data.xvsy) …

21 r  logistic  mixed-model  glmm  lme4-nlme 

Con el siguiente conjunto de datos, quería ver si la respuesta (efecto) cambia con respecto a los sitios, la temporada, la duración y sus interacciones. Algunos foros en línea sobre estadísticas me sugirieron que siguiera con los Modelos lineales de efectos mixtos, pero el problema es que, dado que las …

21 r  mixed-model  lme4-nlme 

He estado buscando modelos de efectos mixtos usando el paquete lme4 en R. Estoy usando principalmente el lmercomando, así que haré mi pregunta a través del código que usa esa sintaxis. Supongo que una pregunta fácil en general podría ser: ¿está bien comparar dos modelos construidos lmerutilizando razones de probabilidad …

20 r  mixed-model  lme4-nlme  likelihood-ratio 

He estado trabajando con algunos datos que tienen algunos problemas con las mediciones repetidas. Al hacerlo, noté un comportamiento muy diferente entre lme()y lmer()usando mis datos de prueba y quiero saber por qué. El conjunto de datos falsos que creé tiene medidas de altura y peso para 10 sujetos, tomados …

20 r  mixed-model  lme4-nlme 

Sabemos que una prueba t emparejada es solo un caso especial de ANOVA de medidas repetidas unidireccionales (o dentro del sujeto), así como el modelo lineal de efectos mixtos, que se puede demostrar con la función lme () del paquete nlme en R Como se muestra abajo. #response data from …

20 r  mixed-model  t-test  repeated-measures  lme4-nlme 

Considere los siguientes datos de un diseño bidireccional dentro de los sujetos: df <- "http://personality-project.org/r/datasets/R.appendix4.data" df <- read.table(df,header=T) head(df) Observation Subject Task Valence Recall 1 1 Jim Free Neg 8 2 2 Jim Free Neu 9 3 3 Jim Free Pos 5 4 4 Jim Cued Neg 7 5 5 …

19 mixed-model  repeated-measures  model-selection  lme4-nlme  likelihood-ratio 

Digamos que tenemos que GLMMs mod1 <- glmer(y ~ x + A + (1|g), data = dat) mod2 <- glmer(y ~ x + B + (1|g), data = dat) Estos modelos no están anidados en el sentido habitual de: a <- glmer(y ~ x + A + (1|g), data = …

19 r  mixed-model  aic  lme4-nlme  nested-models 

Supongamos que estamos trabajando en un modelo de efectos aleatorios de algunos datos de conteo a lo largo del tiempo, y queremos controlar algunas tendencias. Normalmente, harías algo como: lmer(counts ~ dependent_variable + (1+t+I(t^2)|ID), family="poisson") para incluir una forma cuadrática para t. ¿Es posible utilizar algunas técnicas de suavizado más …

19 mixed-model  lme4-nlme  splines 

Hay una distinción que me hace tropezar con modelos mixtos, y me pregunto si podría obtener algo de claridad. Supongamos que tiene un modelo mixto de datos de conteo. Hay una variable que sabe que quiere como efecto fijo (A) y otra variable para el tiempo (T), agrupada por decir …

19 r  mixed-model  lme4-nlme