Preguntas etiquetadas con mpi

¿Quieres mejorar esta publicación? Proporcione respuestas detalladas a esta pregunta, incluidas citas y una explicación de por qué su respuesta es correcta. Las respuestas sin suficiente detalle pueden ser editadas o eliminadas. La versión 3.0 del estándar MPI eliminó formalmente la interfaz C ++ (anteriormente estaba en desuso). Si bien …

28 c++  mpi 

Tengo una aplicación que puede ser paralelamente trivial, pero su rendimiento está en gran medida vinculado a E / S. La aplicación lee una matriz de entrada única almacenada en un archivo que normalmente tiene un tamaño de 2-5 GB (pero espero que este número crezca en el futuro). Un …

20 io  parallel-computing  mpi 

Lo que más me disgusta de MPI es tratar con tipos de datos (es decir, mapas / máscaras de datos) porque no encajan muy bien con C ++ orientado a objetos. boost::mpisolo es compatible con MPI 1.1, sin embargo, desde su sitio web: boost :: mpi es una interfaz amigable …

16 hpc  c++  mpi 

Estoy paralelizando el código para resolver numéricamente un modelo de equilibrio de población de 5 dimensiones. Actualmente tengo un muy buen código paralelo MPICH2 en FORTRAN, pero a medida que aumentamos los valores de los parámetros, las matrices se vuelven demasiado grandes para ejecutarse en modo de memoria distribuida. Tengo …

14 parallel-computing  fortran  numerics  mpi  compiling 

Por lo general, escribo código de serie, y cuando lo hago, escribo pruebas unitarias con un marco de prueba de estilo xUnit (MATLAB xUnit, PyUnit / nose o el marco de prueba C ++ de Google). Basado en una búsqueda superficial de Google, no he visto mucho sobre cómo los …

13 parallel-computing  petsc  mpi  testing  reproducibility 

Estoy trabajando en un problema que se puede paralelizar usando una sola operación mpi_allgather o una operación mpi_scatter y una mpi_gather. Estas operaciones se llaman dentro de un ciclo while, por lo que se pueden llamar muchas veces. En la implementación con un esquema MPI_allgather, estoy reuniendo un vector distribuido …

11 algorithms  complexity  mpi 

Estoy tratando de optimizar una aplicación MPI con un patrón de comunicación altamente asíncrono. Cada rango tiene una lista de cosas para calcular y envía mensajes según sea necesario si las entradas o salidas residen en un rango diferente. Además, cada rango está enhebrado (actualmente con un hilo de comunicación …

10 mpi  visualization 

Estoy buscando referencias creíbles que indiquen la cantidad de recursos que las supercomputadoras gastan en coordinarse en comparación con el trabajo real relacionado con las tareas. Los recursos podrían estar disponibles en potencia de procesamiento, pero incluso los vatios parecen una unidad válida. Creo que uno de mis profesores o …

10 hpc  mpi 

¿Cuál es la diferencia entre estos dos métodos? ¿Se puede resolver un problema con un método que se pueda resolver con el otro? ¿Pueden ambos / o uno de ellos estar en paralelo con OpenMP y / o MPI?

9 mpi  conjugate-gradient 

Al escribir el código MPI 3.0, ¿debería pasar argcy argva la MPI_Initllamada o no, y por qué? EDITAR: Dado que la respuesta de Bill Barth planteó algunas preguntas, quiero hacer algunos comentarios: Pasar argc/ argvno es necesario desde MPI 1.1. La pregunta es específicamente sobre por qué debería / no …

8 c++  c  mpi 

¿Cuál es la política de transferencias asíncronas superpuestas múltiples en MPI? Tengo un programa con varias irecvoperaciones asincrónicas abiertas . Encuentro que las transferencias que podrían tener lugar ( isendse ha llamado al correspondiente ) esperan otras transferencias que aún no están listas (el correspondiente isendaún no se ha llamado). …

8 parallel-computing  software  mpi 

En MPI, ¿hay algún mecanismo incorporado para notificar a un grupo de procesos que necesitan recibir mensajes de otros procesos? En mi aplicación, todos los procesos deben enviar datos a un grupo de procesos con identificadores de rango conocidos (que potencialmente cambian en cada iteración), pero no conocen el rango …

8 mpi 

Tengo un montón de procesos MPI que intercambian mensajes de solicitud de ida y vuelta. Los procesos no saben qué otros procesos les enviarán mensajes, o cuántos. Dada esta situación, quiero una manera eficiente de saber si todos los demás procesos se consideran terminados enviando mensajes. Esto se lograría perfectamente …

8 mpi 

Según tengo entendido, el orden en que se reciben los mensajes MPI punto a punto sin bloqueo (Isend e Irecv) es coherente con el orden en que se envían. ¿Hay alguna técnica para dar prioridad a ciertos mensajes sobre otros? Por ejemplo, tenemos un algoritmo multinivel en el que las …

8 mpi