XMPP es el nuevo nombre, Jabber el viejo. Entonces sí, se refieren a la misma pila de protocolos.
XMPP se utiliza como nombre desde 2002:
A finales de 2001 y principios de 2002, miembros destacados de la comunidad Jabber decidieron presentar una vez más los protocolos básicos de Jabber al IETF, esta vez como una presentación oficial de la JSF. La primera presentación se realizó en febrero de 2002 como un borrador informativo de Internet (texto | HTML). Tras el éxito de esta presentación, se decidió explorar la posibilidad de formar un Grupo de Trabajo IETF dedicado a la formalización de los protocolos básicos de Jabber, bajo el nombre neutral de
Protocolo Extensible de Mensajería y Presencia (XMPP) .
Tal vez algunos antecedentes: el nombre / término 'Jabber' fue comprado por Cisco y ahora es una marca registrada de Cisco.