Pruebas múltiples después de ANCOVA, o más generalmente cualquier GLM, pero las comparaciones ahora se centran en el grupo / tratamiento ajustado o las medias marginales (es decir, cuáles serían los puntajes si los grupos no difieren en la covariable de interés). Que yo sepa, se utilizan las pruebas Tukey HSD y Scheffé. Ambos son bastante conservadores y tenderán a limitar la tasa de error tipo I. Este último se prefiere en caso de tamaño de muestra desigual en cada grupo. Me parece recordar que algunas personas también usan la corrección de Sidak en contrastes específicos (cuando es de interés, por supuesto), ya que es menos conservadora que la corrección de Bonferroni.
Dichas pruebas están fácilmente disponibles en el multcomp
paquete R (ver ?glht
). La viñeta de acompañamiento incluye ejemplos de uso en el caso de un modelo lineal simple (sección 2), pero se puede extender a cualquier otra forma de modelo. Otros ejemplos se pueden encontrar en los HH
paquetes (ver ?MMC
). Varios procedimientos de MCP y remuestreo (recomendados para inferencias fuertes, pero se basa en un enfoque diferente para la corrección de la inflación de la tasa de error Tipo I) también están disponibles en el multtest
paquete, a través de Bioconductor , ver referencias (3–4). La referencia definitiva a la comparación múltiple es el libro de los mismos autores: Dudoit, S. y van der Laan, MJ, Procedimientos de prueba múltiple con aplicaciones a la genómica. (Springer, 2008).
La referencia 2 explica la diferencia entre MCP en el caso general (ANOVA, trabajando con medios no ajustados) vs. ANCOVA. También hay varios documentos que no recuerdo realmente, pero los miraré.
Otras referencias útiles:
- Westfall, PH (1997). Pruebas múltiples de contrastes generales usando contracciones lógicas y correlaciones. JASA 92 : 299-306.
- Westfall, PH y Young, SS (1993) Pruebas múltiples basadas en remuestreo, ejemplos y métodos para el ajuste del valor p . John Wiley and Sons: Nueva York.
- Pollard, KS, Dudoit, S. y van der Laan, MJ (2004). Múltiples procedimientos de prueba: paquete R multtest y aplicaciones a la genómica .
- Taylor, SL Lang, DT, y Pollard, KS (2007). Mejoras en el paquete de prueba múltiple multtest . R Noticias 7 (3) : 52-55.
- Bretz, F., Genz, A. y Hothorn, LA (2001). Sobre la disponibilidad numérica de múltiples procedimientos de comparación. Biometrical Journal , 43 (5) : 645–656.
- Hothorn, T., Bretz, F. y Westfall, P. (2008). Inferencia simultánea en modelos paramétricos generales . Departamento de Estadística: Informes Técnicos, Nr. 19)
Los dos primeros están referenciados en SAS PROC relacionados con MCP.