Corrección de comparaciones múltiples en un dentro de sujetos / medidas repetidas ANOVA; excesivamente conservador?


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Me parece que las correcciones disponibles para comparaciones múltiples en el contexto de un ANOVA de medidas repetidas son excesivamente conservadoras. ¿Es este realmente el caso? Si es así, ¿cuáles son algunas citas que puedo usar para apoyar este punto y obtener más información?


¿A qué tipo de corrección de MP te refieres también? (Por cierto, ¿por qué la alphaetiqueta?)
chl

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re la etiqueta alfa: solo porque las correcciones generalmente están destinadas a mantener alfa constante.
russellpierce

No estoy seguro de lo que significa MP en este contexto, pero estoy hablando de las correcciones de comparaciones múltiples de Bonferroni y / o Sidak de uso frecuente.
russellpierce

Sé que hay otros enfoques, por ejemplo, False Discovery Rate, etc., pero estoy buscando específicamente evaluar y criticar los enfoques más utilizados.
russellpierce

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A medida que sigo investigando, parece haber esencialmente dos campos ... aquellos que tienen un 'mejor enfoque' a través de un término de error agrupado y aquellos que desean ajustar el valor p de acuerdo con algún tipo de procedimiento de comparación múltiple (Bonferonni, Holm ... etc, etc ... parece que hay más de ellos que tengo los dedos).
russellpierce

Respuestas:


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Que yo sepa, la distribución conjunta de los contrastes lineales se ha derivado en el caso ANOVA simple (consulte la documentación del paquete multcomp R), pero no hay formas cerradas para la configuración de medidas repetidas. Sin embargo, siempre puede Bootstrap la distribución conjunta de estos contrastes lineales bajo nulo, y mirar el estadístico t mínimo (o el valor p máximo) para establecer el umbral de significación con el control FWE. Como también sugirió, puede usar métodos que solo requieren alguna condición cualitativa en la distribución conjunta de las estadísticas de prueba. Bonferroni es una buena opción si tienes pocos contrastes. De lo contrario, eche un vistazo a Holm's . Si está buscando muchos contrastes lineales, definitivamente debe preguntarse a sí mismo que desea protección contracualquier descubrimiento falso o solo una proporción de descubrimientos falsos. En el último caso, use el procedimiento BH para el control FDR.


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Aquí hay una colección de enlaces a un foro de SPSS. Espero que lo encuentres relevante hasta cierto punto: esto , esto , esto , esto .


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Gracias por apuntar en una dirección. Lamentablemente, las publicaciones de grupos de noticias están lejos de ser evidencia convincente cuando se discuten estos temas en el trabajo publicado. El manual general sobre la esfericidad es interesante y señala por qué los ajustes del valor p de Bonferroni-stype siguen siendo de uso común. Desafortunadamente, no hay realmente una acusación de la naturaleza conservadora de ese enfoque.
russellpierce
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