La Transformada de Fourier es solo una de las tantas transformaciones diferentes que alteran la representación de (generalmente) una serie temporal desde el dominio del tiempo, a otro dominio (generalmente un dominio de frecuencia, pero existen otras representaciones para otras transformaciones como tiempo / frecuencia, tiempo / escala y otros).
Puede encontrar mucha más información sobre las transformaciones en general en esta lista de artículos de Wikipedia que enumera algunas transformaciones populares y de uso frecuente. (Es posible que desee centrarse en las transformaciones discretas e integrales al principio)
Alternativamente, puede consultar esta discusión reciente sobre cómo la transformada Wavelet logra una descomposición similar a la de la transformada de Fourier.
Finalmente, cuando tiene el lujo de haber adquirido simultáneamente muchas series temporales diferentes del mismo fenómeno, incluso puede emplear técnicas como el Análisis de componentes principales (PCA) y el Análisis de componentes independientes (ICA) que van al punto de transformar una señal en un suma de formas de onda elementales que en realidad se extraen de la señal misma (en lugar de preestablecerse como se hace en Fourier (y transformaciones relacionadas) o Wavelets).