Hay dos mecanismos básicos:
- la salmonella está en la cáscara y cuando el huevo se rompe, el interior se contamina; o
- El sistema reproductivo del pollo está contaminado y pone un huevo con el interior contaminado.
Para reducir la contaminación muy común (un pequeño porcentaje) de cáscara, los huevos vendidos comercialmente tienen sus cáscaras tratadas (generalmente lavadas). Después de lavar, solo alrededor de 50 de cada millón de huevos seguirán teniendo algo de contaminación. La contaminación de la cáscara puede haber estado allí cuando el pollo puso el huevo, a partir de materia fecal o como resultado del procesamiento de la planta.
En algunos casos raros, la salmonela de la superficie puede llegar al interior sin romper el huevo: si estuvo allí mientras la cutícula se secó, si el huevo se almacena a temperatura ambiente o si el ambiente está húmedo.