No puedes ocultar anuncios; está en los términos y condiciones de AdSense en "5. Usos prohibidos":
No deberá, ni autorizará ni alentará a ningún tercero a: ... (ii) editar, modificar, filtrar, truncar o cambiar el orden de la información contenida en cualquier anuncio, enlace, bloque de anuncios, resultado de búsqueda o referencia Abotone, elimine, oculte o minimice cualquier anuncio, enlace, bloque de anuncios, resultado de búsqueda o botón de referencia de cualquier manera sin la autorización de Google;
Me parece bastante claro. (Probablemente se deba a que el código JavaScript del anuncio aún se ejecutaría, informando falsamente una vista del anuncio y retrasando el porcentaje de clics).
Mover el anuncio al área de pie de página para pantallas estrechas utilizando consultas de medios podría ser más seguro.
Actualización (julio de 2013) : el uso de JavaScript para detectar el ancho de página y publicar anuncios relevantes, en lugar de consultas de medios CSS para ocultar anuncios después de que la página se haya cargado y se hayan contado las vistas, ahora parece ser la opción más sensata, como en este ejemplo .