Pude hacer que GNU Screen comenzara a contar ventanas con el número 1 en lugar del 0 predeterminado con este código en mi .screenrc:
# Get rid of screen 0
bind c screen 1
bind ^c screen 1
bind 0 select 10
Cuando creé ventanas en .screenrc lo usé screen 1
para que primero intentara 1 y luego contara si se tomó ese número de ventana.