Instalar R en mi propio directorio

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¿Cómo puedo instalar una nueva versión de R en mi propio directorio /local/data/project/behi?

software-installation not-root-user

— usuario3925736
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Es posible que pueda hacerlo comenzando desde la fuente; pero si tienes que preguntar, supongo que no estás dispuesto a hacerlo. Díganos qué sistema está ejecutando y por qué está interesado en una nueva versión.

— vonbrand

La instalación específica de la versión con código fuente es muy diferente a la instalación con YUM o APT. Depende de la versión del sistema operativo y del número de dependencias que deben cumplirse para que la instalación se complete con éxito. He documentado la instalación de R 3.3.3 en SLES11 SP3 en hashprompt.blogspot.com/2017/06/… Espero que pueda ayudarlo a instalar en sistemas Linux.

— Baban Gaigole

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La forma más fácil de hacer esto es instalar R desde la fuente :

$ wget http://cran.rstudio.com/src/base/R-3/R-3.4.1.tar.gz
$ tar xvf R-3.4.1.tar.gz
$ cd R-3.4.1
$ ./configure --prefix=$HOME/R
$ make && make install

El penúltimo paso es el crítico. Configura R para instalarse en un subdirectorio de su propio directorio de inicio.

Para ejecutarlo en Linux, macOS y sistemas similares, agréguelo $HOME/R/bina su PATH. Luego, los comandos de shell tienen gusto Ry Rscriptfuncionarán.

En macOS, tiene otra alternativa: compilarloR.app e instalarlo en la Applicationscarpeta privada de su usuario . Necesitas tener Xcode instalado para hacer esto.

Puede considerar dar en su --prefix=$HOMElugar. Eso instala R en el nivel superior de su directorio de inicio, de modo que los binarios Ry Rscriptterminan en $HOME/bin, lo que probablemente ya está en su usuario PATH. La desventaja es que dificulta la desinstalación posterior, ya que R estaría entremezclado con sus otros $HOMEcontenidos.

(Si esto es lo primero que ha instalado $HOME/bin, es posible que tenga que cerrar sesión y volver a iniciarla para obtener esto en su PATH, ya que a menudo se agrega condicionalmente solo si $HOME/binexiste en el momento de inicio de sesión).

Este patrón general se aplica a una gran cantidad de software Unix que puede instalar desde el código fuente. Si el software tiene un configurescript, probablemente comprende la --prefixopción, y si no, generalmente hay alguna alternativa con el mismo efecto.

Estas características son comunes por varias razones. En orden decreciente de probabilidad, en mi experiencia:

El valor predeterminado seguro ( /usr/local) no es el correcto $prefixen todas las situaciones. Circunstancias podrían dictar algo distinto, como /usr, /opt/$PKGNAME, etc.
Los sistemas de creación de paquetes binarios ( RPM , DEB , PKG , Cygport ...) generalmente compilan e instalan el paquete en un directorio de preparación especial, luego lo empaquetan de tal manera que se expanda en la ubicación de instalación deseada.
Su caso, donde no puede rootinstalar el software en una ubicación típica, por lo que debe instalarlo en su $HOMElugar.

— Warren Young
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Recomiendo ./configure --prefix=$HOME/R --enable-R-shlibasegurarse de compilar la biblioteca compartida R. De lo contrario, RStudio se quejará.

— akhmed

No me ha funcionado. El guión finalizó con

configure: error: --with-readline=yes (default) and headers/libs are not available make: *** No targets specified and no makefile found.  Stop.

— ApproachingDarknessFish el

@ApproachingDarknessFish: Eso no tiene nada que ver con esta pregunta o mi respuesta. Le faltan los requisitos previos necesarios para construir R en su sistema con las opciones elegidas. Específicamente aquí, te estás perdiendo las bibliotecas de desarrollo de readline. Si tiene más problemas, publique una nueva pregunta.

— Warren Young

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También puede usar la aplicación de envoltura Renv .

extracto

Gestión simple de la versión R: Renv

Renv le permite cambiar fácilmente entre múltiples versiones de R. Es simple, discreto y sigue la tradición de UNIX de herramientas de un solo propósito que hacen bien una cosa.

Renv hace ...

Le permite cambiar la versión global de R por usuario.

Proporcionar soporte para versiones R por proyecto.

Le permite anular la versión R con una variable de entorno.

— slm
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Construir desde la fuente con ./configure --prefix=/local/data/project/behi ; make ; make install

Si está instalando desde un paquete RPM y se creó reubicable, puede usar

rpm ... --prefix /local/data/project/behi

Pero no todos los paquetes están construidos con binarios reubicables, y no creo que los paquetes de Debian tengan esta opción (aunque podría tener éxito dpkg --instdir).

— Dani_l
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