Respuestas:
El comentario de Yeti funcionará para usted, pero si desea saber por qué, se debe a que los paréntesis se interpretan como caracteres especiales, y deben omitirse con \el nombre de archivo completo o citado (como se indicó anteriormente) [editar: lo siento, solo el (y ) necesita ser citado].
Si tiene habilitada la finalización de pestañas, simplemente escriba los primeros caracteres del nombre del archivo y presione la pestaña. Es decir, escribir mv oldy presionar la pestaña, debería convertirse en mv old.file\(1\).gz(a menos que haya otros archivos potenciales a los que se old*pueda hacer referencia).
()hacer. Puedes hacerlo mv old.fil'e(1).'gz new.file.gzsi quieres.
mv 'old.file(1).gz' new.file.gz
Debería solucionar el problema.
mv 'old.file(1).gz' new.file.gz.