En teoría, solo puede instalar el nuevo ubuntu y hacer particiones manualmente durante el proceso de instalación, eligiendo mantener su antigua partición doméstica (es decir, sin formatearla) vinculada al punto de montaje / home.
El problema es que en su hogar se guardan todos los archivos de configuración para gnome, firefox y muchos otros programas grandes que probablemente tenía en su sistema anterior. Por lo tanto, instalar un sistema completamente nuevo con dichos archivos de configuración ya existentes puede convertirse en un problema si algún software ha cambiado mucho desde que se lanzó su antiguo ubuntu.
Entonces, en la práctica, sugeriría hacer una copia de los datos que están en su hogar, instalar el nuevo sistema que mantiene su hogar como dije, y si surge algún problema serio con algún software, puede eliminar el usuario (junto con su directorio de inicio) y recrearlo.