Primero, algunas aclaraciones, porque siento que no entiendes cómo surgieron los sistemas GNU / Linux. Ten paciencia conmigo si esto no es nada nuevo para ti:
"Kernel" no es solo otro programa que se ejecuta, sino que es la parte del sistema operativo que proporciona las funciones básicas: si desea iniciar un programa (digamos que escribe "ls" en la línea de comando) el binario debe cargarse desde el disco (que incluye algunas operaciones del sistema de archivos para localizarlo y algún manejo de archivos para leerlo), luego se crea un "entorno de proceso": se asigna memoria, se emite un número de proceso, etc., etc. Todas las actividades anteriores (FS, lectura de archivo, ...) son manejados por las bibliotecas del sistema, pero las últimas son funciones del núcleo. En cierto sentido, el núcleo "es el sistema operativo" y todo lo demás es solo decoración a su alrededor.
"Linux" es de hecho (¡solo!) Un núcleo sin otras partes de un sistema operativo. Linus Torvalds comenzó a escribirlo tomando el núcleo del sistema operativo de la plantilla MINIX de Andrew Tanenbaums y completándolo para que fuera un núcleo real y funcional. Hasta el día de hoy, hay Linus (y muchos otros que contribuyen / han contribuido) que desarrollan este núcleo. Este núcleo sigue siendo muy similar a UNIX, pero NO es un núcleo UNIX.
"GNU" comenzó como una iniciativa para "mejorar" muchos comandos comunes de UNIX. No discutiré si tuvieron éxito o no, pero definitivamente escribieron mucho software y en un momento tuvieron una colección de programas de utilidad. Incluso comenzaron a desarrollar un núcleo de sistema operativo propio (HURD), que se basaba en gran medida en UNIX, pero definitivamente era diferente. Pero hasta el día de hoy HURD está en su desarrollo inicial y apenas es una solución que funcione. "GNU" por cierto. es la abreviatura de "GNU (is) Not UNIX" - trataron de superar algunas limitaciones (percibidas o reales) de UNIX con la intención de crear un sucesor para UNIX (de nuevo: no quiero entrar en la discusión si tuvieron éxito o no, no me importa si es "mejor" o "peor", ¡pero definitivamente es diferente!).
Entonces, con un conjunto de herramientas que carecen de un núcleo y un núcleo que carece de un conjunto de herramientas, fue un desarrollo natural juntar estos dos: se creó GNU / Linux.
Aún así, para tener un SO operativo (y viable) necesita algo más que un núcleo y un conjunto de herramientas: necesita un sistema de gestión de paquetes, necesita procedimientos de instalación, necesita configuraciones de plantilla, necesita ...
Varias personas diferentes (o grupos de ellos) llegaron a esta conclusión y usaron la combinación GNU / Linux para crear un sistema GNU / Linux de su agrado, agregando exactamente las cosas de las que hablé anteriormente: crearon un administrador de paquetes, un sistema de empaque , procedimientos de instalación y qué más. Estos diferentes grupos (respectivamente, los resultados de sus esfuerzos) son las diferentes distribuciones. Hoy en día existen tres administradores de paquetes diferentes (aptos para Debian y sistemas derivados como * ubuntu, rpm para RedHat y sistemas derivados como Fedora, CentOS y más, pacman para ArchLinux) pero todos estos solo administran paquetes de software que es (esencialmente) lo mismo: cómo se llama cuando emite "ls" o "df", etc.,
Entonces, "en principio" puede actualizar el núcleo solo, como lo hicieron las personas que crearon una distribución a partir de varias versiones de todo el software que mencioné anteriormente.
Pero, y este es un gran PERO: porque no solo hay el kernel y algún software adicional, sino muchas otras cosas a tener en cuenta, como las herramientas de configuración del sistema (systemd, que algunas distribuciones usan y otras no), la red herramientas de administración como NetworkManager, que a su vez depende de algunas versiones de la biblioteca GNOME, etc., etc. - una "distribución" es algo bastante complejo y es probable que si intentas actualizar el kernel termines actualizando mucho otras cosas debido a las muchas interdependencias.
Aún así, y también "en principio", como arriba: también puede crear su propia distribución descargando todas las fuentes, compilándolas, encontrar un conjunto de combinaciones de versiones que funcionen, poner algún sistema de empaque en su lugar (o usar uno de los existentes) ) - y así sucesivamente, hasta que tenga un sistema distribuible, instalable y configurable. Esto es lo que hacen los creadores de distribuciones como Ubuntu y no es un milagro, solo un montón de trabajo complejo, por lo que en realidad la mayoría de los usuarios evitan eso y usan algo que pueden listos para usar.
Espero que esto responda tu pregunta.