Respuestas:
HandBrake es una aplicación de software de transcodificador de video multiproceso, multiplataforma y de código abierto de uso general que es más que capaz de leer la carpeta VIDEO_TS y convertirla al formato de archivo que usted elija.
FFmpeg también funciona bastante bien:
cat ./VIDEO_TS/*.VOB | ffmpeg -i - <out_name>.<out_format>
Fuente:
https://wiki.archlinux.org/index.php/FFmpeg#VOB_to_any_container
K9Copy es una herramienta poderosa que puede leer una estructura de directorio VIDEO_TS (o un DVD) y producir (volver a codificar) archivos de video MPEG-4. También es compatible con la extracción MPEG-2, que es útil para crear copias de seguridad sin pérdidas (se creará un archivo de video MPEG-2 para cada episodio / video en el DVD). Es posible copiar solo la pista de audio en inglés y los subtítulos.
Para instalar K9Copy en Ubuntu , debe habilitar el repositorio multiverso, ya sea cambiando el archivo de configuración o utilizando la interfaz gráfica de usuario de Software Sources. Otras distribuciones como Fedora lo tienen en su repositorio predeterminado.