Método GUI
Busque la configuración a bordo desde la descripción general de gnome-shell.
En la pestaña General y el encabezado de integración de escritorio , desmarque la opción Mostrar a bordo cuando desbloquee la pantalla .

Método de línea de comandos
Gracias a la respuesta de fossfreedom a una pregunta similar
Ejecute el siguiente comando en una terminal:
gsettings set apps.onboard xembed-onboard false
Si lo anterior no funciona, prueba este:
gsettings set org.gnome.desktop.screensaver embedded-keyboard-enabled false
funcionó para mí (Ubuntu 12.04).