¿El sistema se está quedando sin memoria?
Puede echar un vistazo /var/log/syslogpara ver si recibe algún mensaje OOM(Sin memoria) durante la hora del día cuando se /etc/cron.daily/aptestá ejecutando.
/etc/cron.daily/apt se ejecuta a las 06:25, pero hay una suspensión aleatoria en el script apt, por lo que puede ser hasta 1800 segundos más tarde
El comando free -mtambién podrá decirle cuánta memoria libre tiene, y vmstat 5podrá mostrarle si tiene muchos intercambios o movimientos de memoria.
Si este es el caso, podría considerar agregar más intercambio , agregar más memoria o descubrir si tiene procesos innecesarios en ejecución que ocupan toda su memoria. (Un reinicio en el caso de una pérdida de memoria)
Ejecutar apt manualmente?
¿Has intentado ejecutar /etc/cron.daily/aptmanualmente para ver si puedes más advertencias / errores?
Si está ejecutando Ubuntu 14.04 LTS, encontrará una llamada a la random_sleepsubrutina activada line 425. Agregue un #en esta línea para que no duerma antes de una carrera.
En Ubuntu 12.04 LTS lo es line 423. Ubuntu 16.04 LTS no debería tener este archivo por lo que puedo ver.
Ejecutar /etc/cron.daily/aptcomo root de esta manera:
root@hostname:~# /etc/cron.daily/apt
O con sudoesto:
username@hostname:~$ sudo /etc/cron.daily/apt
Puede haber algunos errores interesantes para señalarle la dirección correcta, o intente buscar en el /var/log/syslogarchivo algo sospechoso.