Cuando arrastra y suelta una carpeta con nautilus, debe configurar cuidadosamente ambas ventanas en áreas no superpuestas de su pantalla, de lo contrario, al seleccionar una carpeta, las ventanas se mostrarán al frente, ocultando la segunda.
En Windows, al hacerlo, pegará las ventanas explorer.exe en la parte posterior y le permitirá arrastrar y soltar la carpeta. Supongo que detecta un clic largo para decidir si traer la ventana al frente o no.
¿Es eso posible con Ubuntu?
Ahora sé que Nautilus ahora tiene paneles divididos presionando F3, pero eso no es útil. La mayoría de las veces, abres una carpeta, y luego decides copiar. Con el panel dividido, debe decidir, ENTONCES dividir el panel e ir a la carpeta correcta.