Algunos de geditlos elementos del menú solo se pueden ver cuando indicator-appmenuestá instalado. Prueba esto:
sudo apt-get install indicator-appmenu
Cerrar sesión e iniciar sesión nuevamente. Vea si el menú de la geditaplicación aparece en la parte superior de la pantalla (no en la parte superior de la ventana de la aplicación). Si es así, debería poder encontrar la Preferencesopción allí.
Si no desea que el menú aparezca en la parte superior de la pantalla (como I), puede eliminarlo después.
sudo apt-get remove indicator-appmenu
No olvide cerrar sesión e iniciar sesión nuevamente.