Respuestas:
Si usa el shell predeterminado (bash), puede usar lo siguiente:
for file in *.MOV; do ffmpeg2theora "$file"; done
nocaseglobopción bash para que coincida con las minúsculas, mayúsculas y las extensiones de archivo de mayúsculas y minúsculas.
find . -iname '*.mov' -exec ffmpeg2theora '{}' \;
Para limitar la profundidad de recursión, puede agregar -maxdepth 1antes-exec
for file in *.MOVsolución solo buscará en el directorio actual.
for file in *.[Mm][Oo][Vv]; do ffmpeg2theora "$file"; done