Para responder a su primera pregunta, el disco duro simplemente estará más activo debido a la actividad de E / S de disco mucho más frecuente de Windows. No estoy realmente seguro de cuál es la causa raíz del aumento de la actividad del disco, pero tenga en cuenta que los requisitos de memoria de Windows 7 son mucho más altos que los de Ubuntu. Por lo tanto, Windows usará el archivo de intercambio con mayor frecuencia, y eso generará una mayor actividad del disco.
Una segunda causa podría ser los numerosos 'análisis' que ejecuta Windows. Esto incluye el indexador de archivos (a menos que lo haya desactivado), escaneos de spyware / virus, etc. Estos a veces se ejecutan sin ninguna indicación y realmente pueden poner algo de estrés en el disco.
La tercera razón podría ser simplemente el sistema de archivos en sí mismo: Windows usa el sistema de archivos NTFS de manera predeterminada y Ubuntu usa Ext4 de manera predeterminada. Mi propia experiencia ha demostrado que Ext4 es mucho más rápido en operaciones de archivos masivos que NTFS. (Nada oficial, pero ciertamente reproducible).