Respuestas:
Diferencias técnicas
Unity-2D se utiliza con computadoras que no admiten gráficos acelerados en 3D, como algunas netbooks de gama baja. Unity-2D se ve casi exactamente igual a su contraparte en 3D, aunque sin un poco de lo más atractivo.
En cuanto a las actualizaciones, ambas deben actualizarse al mismo tiempo, aunque espero que Unity-3D tenga un poco más de esfuerzo debido al hecho de que es la versión "convencional" de Unity.
Unity 2D comenzó desde net books y era nuevo. Lo usé en mis net books. Unity 3D será el valor predeterminado para 11.04.