Hasta donde sé, no hay lugar para los scripts personalizados de Linux. El directorio que debe usarse para la instalación personalizada es el /optdirectorio, por lo que sería la opción más segura colocarlos allí. Pero tenga en cuenta que para que un script se pueda usar sin la ruta completa, necesita que se incluya en la variable PATH.
Si necesita ayuda para cambiar la PATHvariable para todos los usuarios, puede consultar ¿Cómo configuro las variables PATH para todos los usuarios en un servidor? que lo remite al /etc/environmentarchivo para configurar esto.
Si su preocupación es evitar conflictos, pero no desea agregar otra ruta a la variable PATH que podría usar /usr/local/bin. En la instalación de mi servidor no tiene ningún archivo, por lo que podría ser una solución fácil.
Espero eso ayude