La respuesta bastante simplificada es que Zeitgeist registra sus archivos accedidos, los sitios visitados, etc. (sus acciones de uso de la computadora) y los almacena LOCALMENTE. Si su contraseña es vulnerable, la base de datos Zeitgeist es igual de vulnerable. Varios programadores de Linux han investigado a fondo "es Z cargando cualquier cosa sobre usted", y la respuesta es no, no lo es. Es para facilitar las búsquedas y 'ajustar mejor' a su consulta local solamente. Dicho esto, si está usando Firefox, Chrome, etc. como navegador, su navegador ya está registrando sus acciones y SE ESTÁN cargando, dependiendo del sitio que visite y de lo que quieran saber en relación con los metadatos.
Si desea apagar su Zeitgeist local, simplemente vaya a CONFIGURACIÓN DEL SISTEMA> CONFIGURACIÓN DE SEGURIDAD Y PRIVACIDAD (en 14.04LTS, su versión puede variar), y luego en la pestaña Archivos y aplicaciones, desactive el botón 'Grabar archivos y aplicaciones'. Si realmente le preocupa, elimine su historial allí también. Esto borra la base de datos. Ahora, Zeitgeist es residente, pero está apagado.
Mi paranoia proviene mucho más del registro de CUALQUIER navegador que uso, luego de Linux o Ubuntu.