Virtualbox:
Ubuntu se ejecutará dentro de su sistema operativo Windows existente. Podrá ejecutar Ubuntu simultáneamente mientras usa otras aplicaciones de Windows. Sin embargo, Ubuntu se ejecutará con bastante lentitud, en su propio cuadro (que aún puede ser maximizado) y no será representativo de una instalación real de Ubuntu, sin hacer un uso completo de su hardware. En mi humilde opinión, será frustrantemente limitado si quieres una experiencia de escritorio completa. Sin embargo, puede ser útil si desea utilizar Windows como su sistema operativo principal pero necesita ejecutar un programa Linux específico, o un servidor Linux, para fines de prueba.
Partición propia:
Ubuntu se ejecutará de forma nativa en su máquina, por separado de Windows. No podrá ejecutar los dos simultáneamente, pero puede elegir cuál ejecutar cuando arranque. Esta es una buena opción si desea obtener una experiencia de escritorio completa, siempre y cuando pueda cambiar el tamaño de algunas particiones existentes para hacer espacio y esté razonablemente seguro de hacerlo (es decir, no destruirá sus particiones existentes, y eres bueno con las copias de seguridad). Si está pensando en mudarse a Ubuntu de forma permanente en el futuro, esta es la única opción de las tres que le permitirá hacerlo sin problemas, ya que podrá eliminar o reducir su partición de Windows más tarde sin afectar a Ubuntu.
Wubi:
Una vez instalado, esto es prácticamente lo mismo que ejecutar Ubuntu en su propia partición: no podrá ejecutar Ubuntu y Windows simultáneamente, Ubuntu tendrá acceso completo a su hardware y podrá elegir Ubuntu o Windows cuando arranque. Sin embargo, esta opción es para cuando no desea la permanencia de cambiar el tamaño de las particiones existentes. Es bueno si desea probar Ubuntu temporalmente sin cambiar ninguna partición. El truco aquí es que la magia especial te permite crear la partición de Ubuntu como una partición virtual dentrosu partición de Windows existente, en lugar de crear una partición real en el disco. Sin embargo, Ubuntu lo verá como su propia partición y Windows lo verá como un archivo normal. Sin embargo, no podrá eliminar su partición de Windows, por eso dije que es bueno si su uso de Ubuntu es temporal. Es plausible que el acceso al disco sea un poco más lento usando este método que tener Ubuntu en su propia partición, pero esto puede no ser notable y en todas las demás formas Ubuntu se ejecutará igual de rápido.
Además, si elijo particionar, ¿debería particionar el disco duro o dejar que el menú de instalación de Ubuntu lo haga por mí?
Esto en sí mismo es una pregunta bastante amplia y diez personas diferentes tendrán diez opiniones diferentes sobre esto. En mi opinión, también puedes dejar que Ubuntu elija su propia partición. Esto dará como resultado una pequeña partición para el intercambio y una más grande para todo lo demás. Algunos dicen que vale la pena tener una partición separada / casera. Puede hacerlo si lo desea, aunque si no sabe que lo necesita, es probable que realmente no lo necesite. Los beneficios de un / home separado para algunas personas es que pueden tirar todo a la basura, pero mantener la partición / home, por lo que sus archivos permanecen, cuando quieren hacer una reinstalación limpia. Por supuesto, si tiene copias de seguridad de sus archivos, puede optar por restaurar desde copias de seguridad.