Puede haber algunas molestias en el camino. Algunos de los componentes propietarios de Ubuntu (como el tiempo de ejecución de Oracle Java y Adobe Flash) pueden ser un poco más difíciles de instalar de lo que cabría esperar.
También puede haber problemas con algunos controladores inalámbricos oscuros y similares, pero esta es la excepción y no la regla.
Aparte de eso, la excelente capa de compatibilidad de 32 bits de Linux asegura que su sistema será bastante sólido y, a menudo, bastante mejor en tareas de cómputo que se benefician del mayor tamaño de la dirección.
El servidor Ubuntu ahora es recomendado por canonical en su forma de 64 bits por defecto. En general, hay mucha confianza en la arquitectura Linux de 64 bits. Ya no es experimental, ya no es solo un complemento. Y a pesar de que algunas de las aplicaciones no se han puesto al día (la memoria flash es la única que realmente importa), el kernel de Linux ahora se considera un sistema de 64 bits con una capa de compatibilidad de 32 bits, en lugar de lo contrario.
En resumen: hágalo, vaya a 64 bits : hoy ejecuta millones y millones de servidores Linux y está completamente listo para su escritorio.
Como señala Huygens, 32 bit es la apuesta segura . Si puede soportar la molestia potencial de reinstalar la versión de 32 bits, tiene sentido probar primero con 64 bits y probar si hay problemas comunes.
El instalador de 32 bits, por supuesto, habilitará automáticamente un núcleo PAE si tiene más memoria RAM que luego se puede abordar en 32 bits, lo que hace que el problema de la memoria RAM sea cosa del pasado. Esto se ha dicho muchas veces aquí, pero ¿por qué no incluirlo nuevamente? :)