¡He encontrado la respuesta! En el menú Wine hice clic en "Unistall Wine Software".
Esto abre una ventana para agregar / quitar. Simplemente selecciono la aplicación y luego hago clic en el botón "Modificar / Revocar".
Sin embargo, por algunas razones que no puedo entender, tengo que hacer la misma operación dos veces. ¡Después de hacer clic en Aceptar tres veces, todavía veo el programa en la lista! Cuando lo selecciono y luego hago clic nuevamente en el botón "Modificar / Eliminar", obtengo esto:
Hago clic en el botón "Sí" y, finalmente, la aplicación desaparece de la lista. Pero después de eso, tengo que limpiar los accesos directos y la carpeta manualmente. Desearía poder encontrar una solución más fácil y limpia, pero esta funciona bien de todos modos.