tl; dr: a los aeropuertos les gusta vender bebidas (y puede aumentar la seguridad)
Según lo descrito por @jpatokal, de hecho es posible fabricar explosivos con algunos líquidos y, por lo tanto, las aerolíneas utilizaron la seguridad como una razón para prohibir todos los líquidos.
Aunque la cantidad de ataques terroristas evitados por esto probablemente esté en el rango de 0-1 (lo que, por supuesto, podría hacer que valga la pena el esfuerzo), hay un efecto secundario que se nota fácilmente:
Dado que es más difícil para las personas organizar sus propias bebidas, aumenta la cantidad de bebidas compradas en un aeropuerto. No he podido encontrar una cita para esto, pero puedo dar fe de esto por experiencia personal.
Por lo tanto, evitar que las personas tomen botellas puede aumentar la seguridad, pero definitivamente aumentará los ingresos. Y esta es al menos parte de la razón por la cual la regla obtuvo suficiente apoyo para implementarse.