Ambos son realmente fáciles de alcanzar. Como señaló Artem, puede tomar NJ Transit desde Newark a NY Penn Station, que es más cómoda que el metro.
En realidad, puede hacer un viaje casi idéntico desde JFK: toma el AirTrain desde su terminal hasta la parada de Jamaica, luego puede transferirlo a cualquier tren de Long Island Railroad Railroad (LIRR). Usted termina en la misma ubicación céntrica y conveniente de Manhattan que la opción NJ Transit de Newark.
Puede ser una mejor opción volar a JFK, dado que es un fin de semana. Parece que el LIRR funciona con más frecuencia a esa hora del día los sábados (~ 3 veces por hora). Los trenes NJ Transit parecen estar a las: 04 y: 15 de la hora, por lo que podría terminar esperando ~ 50 minutos para un tren. (Puede ver el horario de tránsito de NJ - seleccione el aeropuerto de Newark a la estación Penn de Nueva York - y el horario de LIRR - Jamaica a la estación Penn - usted mismo). Ambas opciones le costarán alrededor de $ 12-15 dólares por persona por trayecto, y lo llevará directamente al centro de Manhattan con conexiones fáciles a aproximadamente 8 líneas de metro.
También tiene la opción de tomar 2 autobuses desde Newark a Penn Station , que según Google Maps es aproximadamente la misma cantidad de tiempo (~ 40 minutos) que tomar el tren desde JFK . Eso, por supuesto, no tiene en cuenta el tráfico que puede experimentar en el autobús.
JFK tiene la opción adicional de tomar un metro hacia Manhattan. Si bien es más barato ($ 5 para AirTrain + $ 2.25 para el metro), encuentro que esta opción lleva mucho más tiempo, y si está llena, lidiar con el equipaje puede ser una molestia.
About.com tiene un buen resumen de todas sus diferentes opciones para viajes JFK-Manhattan, así como viajes EWR-Manhattan . (Hay autobuses disponibles desde ambos aeropuertos a varios lugares de Manhattan, pero no puedo hablar por experiencia sobre ellos).
Mi recomendación personal sería volar a JFK; llevar el AirTrain a LIRR es una buena opción en el medio de la carretera que combina conveniencia, comodidad y asequibilidad. (Los taxis son caros, los autobuses suelen ser más lentos y llenos de gente, los subterráneos son impredecibles y nunca he tomado el autobús de enlace).