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¿Dónde pongo los comandos para ejecutar scripts?
Estoy tratando de ejecutar algunos scripts (ya sean python, java, etc). Los desarrolladores en su documentación me dan un código para que yo ingrese. Aquí hay algunos ejemplos: java -Xmx2g -jar muTect-XXXX-XX-XX.jar --analysis_type MuTect --reference_sequence <reference> --cosmic <cosmic.vcf> --dbsnp <dbsnp.vcf> --intervals <intervals_to_process> --input_file:normal <normal.bam> --input_file:tumor <tumor.bam> --out <call_stats.out> --coverage_file <coverage.wig.txt> …