También tengo el mismo problema. Actualmente estoy ejecutando 4 monitores, ambos en hardware nvidia, con dos en un FX 5500 anterior y los otros dos en mi 9400 GT más nuevo. Tomó algo de trabajo hacer que las diferentes generaciones de conductores jugaran bien juntas.
Creo que Windows está teniendo problemas para combinar las imágenes de los framebuffers en diferentes ubicaciones de RAM física (mitad en una tarjeta, mitad en la otra).
Esa es mi suposición de todos modos.
Los síntomas son los mismos: la pantalla de impresión alternativa funciona como un campeón, pero la pantalla de impresión de todo el escritorio parece que ni siquiera captura una imagen. Photoshop generalmente conoce el tamaño de la imagen en el portapapeles, y ctrl-n creará un nuevo documento con esas dimensiones. El tamaño de mi escritorio es 5120x1024, pero el nuevo documento se creó a 900x1585 (probablemente del tamaño de lo que pegué allí por última vez).
Debería tener mucha RAM. Intenté reducir la aceleración de hardware en los cuatro monitores al nivel mínimo, y todavía no sucede nada. Apagué la combinación de escritura, y eso podría hacer algo (solo una puñalada en la oscuridad), pero no lo sabré hasta después de reiniciar.
Por ahora, Gadwin Printscreen (descarga gratuita) hizo el truco, pero solo capturó mi pantalla principal.