Tiene que ver con la función de apagado híbrido de Windows 10 (también conocido como arranque rápido). Ver http://www.howtogeek.com/236807/how-to-mount-your-windows-10-or-8-system-drive-on-linux/ .
Solución a corto plazo: asegúrese de seleccionar la opción "Reiniciar" en Windows en lugar de la opción "Apagar" cuando desee cambiar a Linux.
A largo plazo: deshabilite permanentemente el arranque híbrido desde Windows, el Panel de control de opciones de energía y haga clic en "Cambiar lo que hacen los botones de encendido". Es posible que tenga que hacer clic en el enlace "Cambiar la configuración que actualmente no está disponible" para habilitar el cambio de esta configuración. Desplácese hacia abajo y desmarque la opción "Activar inicio rápido (recomendado)". Haga clic en "Guardar cambios" para guardar sus cambios.
La próxima vez que cierre Windows, se cerrará por completo, como siempre lo hizo Windows 7.