Como regla general, sí, es "seguro" desinstalar Chocolatey. Chocolatey, en su mayor parte, es simplemente una envoltura alrededor del EXE / MSI nativo para la aplicación que se está instalando. Como resultado, la eliminación de Chocolatey no elimina las aplicaciones instaladas.
Hay algunos tipos de aplicaciones, por ejemplo, línea de comandos / portátiles, que tendrán un efecto adverso al eliminar Chocolatey, por lo que es posible que desee tener un poco de cuidado aquí. Por ejemplo, al instalar, por ejemplo, GitVersion.Portable, Chocolatey agrega un "acceso directo" al EXE resultante en la carpeta Bin de Chocolatey (que se encuentra en la ruta del sistema). Al desinstalar Chocolatey, este "acceso directo" y potencialmente el propio EXE, se eliminarán, por lo que esta aplicación ya no funcionará.
Le sugiero que eche un vistazo a la carpeta Chocolatey \ Lib, y vea qué paquetes ha instalado con Chocolatey antes de desinstalar, para que pueda verificar que ninguna aplicación cae en esta categoría.
¡Espero que ayude!
Los pasos para desinstalar Chocolatey se enumeran aquí .
Como nota al margen, comenzando con Chocolatey 0.9.8.27, la ruta predeterminada de Chocolatey ya no es C: \ Chocolatey, sino C: \ ProgramData \ Chocolatey.