Hay una herramienta excelente, gratuita y de código abierto llamada Briss . Es muy simple, fácil de usar y efectivo. Funciona en múltiples sistemas operativos a través de Java.
Cargue su PDF en la aplicación. La aplicación agrupará páginas similares y las colocará una encima de la otra. Dibuja rectángulos en la parte superior de tus páginas para que cubran lo que quieres incluir. Se verá así:
Incluso si su PDF tiene múltiples categorías de diseño dentro de un solo documento, Briss lo manejará. Por ejemplo, supongamos que algunas partes están en vertical y otras en horizontal. Briss los agrupará en diferentes categorías y le permitirá dibujar diferentes rectángulos en ellos, y luego procesarlo todo en una sola pasada, en un solo documento. Briss es muy bueno para decidir qué páginas deben agruparse. Por lo general, me lleva menos de un minuto de trabajo manual comenzar Briss. Por lo tanto, se puede hacer un documento de cientos o incluso miles de páginas en un par de minutos gracias a este brillante programa.
Cuando se ve bien, seleccione Acción , luego Recortar PDF .
Realmente una herramienta muy ordenada.
Nota: Me doy cuenta de que esta respuesta se lee como si fuera un desarrollador Briss o algo así, pero realmente no lo soy. Me encanta la herramienta.