Recientemente he notado en mi PC con Windows 7 x64 que Inkscape (v0.48.4) tarda mucho en iniciarse. Una vez que la ventana esté visible, mostrará "No responde" en la barra de título durante un minuto o dos. Una vez que sale de este ajuste, funciona normalmente y sin problemas.
Intenté eliminar el perfil de usuario de Inkscape ( %APPDATA%\Inkscape
) y eso ayudó por un tiempo. Pero el problema apareció nuevamente dentro de una semana.