Es posible que desee ver un par de enlaces para obtener antecedentes:
Re. qué versión de Flash se utilizará ... allí nuevamente hay cambios (próximamente). Google planea bloquear todos los complementos de NPAPI: despedirse de nuestro viejo amigo NPAPI . Así que eso no será un problema en 2014. Hace bastante tiempo, recuerdo que si hubiera dos complementos disponibles, no tendrían la misma "prioridad" y, por lo tanto, se ejecutaría el que tenga la prioridad más alta. Para obtener una visión más antigua sobre el tema, consulte ¿Por qué se ejecutan dos complementos de Flash Player en Google Chrome? .
Re. cuál debe desactivar ... Sugeriría no molestarse a menos que tenga un problema con el PPAPI. No es que ambos consuman recursos cuando ves contenido Flash.
( Para usuarios de Linux ...
Adobe solo proporcionará actualizaciones de "seguridad" para Flash en Linux. Por lo tanto, 11.2.202 fue la versión completa "final" de la versión NPAPI.
Google, en colaboración con Adobe, proporcionará la versión PPAPI de Flash para Linux. )