Si ejecuto tmuxdesde mi shell cygwin bash, se imprime 1;2cen mi mensaje después de que se inicia tmux. Si me adjunto a una sesión que había abierto anteriormente, usarla tmux attach-sessionhace lo mismo. Si tenía vim abierto en esa sesión, actuará como si hubiera escrito 1;2cvim.
Hice mi .bashrcvacío para saber que está siendo causado por tmux, no por mi configuración de bash.
tmux 1.9a1ahora está disponible como paquete preconstruido en Cygwin. Sin embargo, este problema todavía está presente usando la última versión libevent 2.0.21. Esta pregunta SE se ha vinculado en la lista de correo cygwin. Esperemos que el problema se resuelva pronto.