Elegiría ninguno de los dos y los convertiría en un contenedor MPEG-4 Parte 14 (ISO / IEC 14496-14) (conocido como "MP4").
los Formato de archivo QuickTime (QTFF) fue la base para MP4. Ofrecen (más o menos) el mismo soporte para códecs de video, audio y subtítulos. Sin embargo, encontrará muchos dispositivos que no pueden leer archivos MOV en absoluto. Reproducir archivos MOV de forma nativa en versiones anteriores de Windows no es posible, por ejemplo.
Matroska , si bien es de código abierto, no está estandarizado por la ISO. Es posible que esto realmente no importe, y de hecho, es un estándar abierto, pero el soporte de reproducción de dispositivos para archivos MKV solo se está recuperando muy despacio. Es un formato de contenedor prometedor, pero probablemente nunca lo verá siendo usado para ninguna aplicación real, aparte de compartir videos en la web.
El pasado ha demostrado que cuando las empresas crean aplicaciones o servicios que se implementan para la electrónica de consumo o cualquier tipo de interés público, se basan en estándares bien establecidos, que a su vez son en su mayoría los publicados por la UIT o la ISO.
Piense en la transmisión DVB, que usa MPEG-2, el DVD, que también usa MPEG-2, o discos Blu-ray, que usan video MPEG-4 Parte 10 (AVC). Todas las cámaras de video graban alguna variante de video MPEG-4 en estos días y usan formatos de almacenamiento definidos en MPEG-4 o muy relacionados con ellos (por ejemplo, AVCHD).
Iniciativas recientes han suscitado el debate sobre las patentes de software en varios códecs de audio y video, especialmente con respecto a Video HTML5 —Pero esto no es realmente un problema con los formatos de almacenamiento como MP4.