Respuestas:
Resulta que la solución es ejecutar los siguientes comandos:
sudo rm /usr/bin/jar
sudo rm /var/lib/alternatives/jar
sudo alternatives --install /usr/bin/jar jar /usr/java/latest/bin/jar 20000
puede confirmar que los pasos anteriores funcionaron con:
which jar
Yo diría que esos pasos son bastante genéricos y también podrían usarse para otras aplicaciones alternativas.
Consulte http://johnglotzer.blogspot.com/2012/09/alternatives-install-gets-stuck-failed.html para obtener más información.