Respuestas:
Las notas se almacenan como HTML en un formato binario aparentemente no estándar en ~/Library/Containers/com.apple.Notes/Data/Library/Notes/NotesV1.storedata-wal.
Para los grepcontenidos de notas conocidos en la línea de comandos, puede imprimir todas las notas (almacenadas como HTML):
cat ~/Library/Containers/com.apple.Notes/Data/Library/Notes/NotesV1.storedata-wal | grep -aio '<html>.*</html>'
Mientras escribía esta respuesta, también tuve el problema una vez que Notes se reinició con el restablecimiento de datos. El siguiente lanzamiento, todo estaba allí nuevamente, a pesar de que había creado nuevas notas después del reinicio (por lo que tanto las notas antiguas como las nuevas existían en el tercer lanzamiento). ¿Quizás solo intente salir y comenzar Notes nuevamente?
~/Library/Containers/com.apple.Notes/Data/Library/Notes/NotesV1.storedata.
Encontré este artículo que parece ayudar: http://applehelpwriter.com/2013/03/02/how-to-recover-disappearing-notes/
cd ~/Library/Containers/com.apple.Notes/Data/Library/Notes; strings NotesV1.storedata | grep body | open -f
En OS X Lion (10.7), encontré mis notas en el archivo a continuación.
~ / Library / StickiesDatabase