Si necesitas preguntar ...
Bueno, prácticamente en un sistema moderno, especialmente como un servidor de algún tipo, puede arreglárselas sin ninguna. Puede ir con el video incorporado (evitando el uso de una ranura PCI-E para la tarjeta de video), Ethernet (así que no lo haga). t necesita una ranura de expansión para eso tampoco) y así sucesivamente. La mayoría de los tableros modernos son prácticamente autónomos.
En lo que respecta a un sistema de servidor doméstico, puedo ver las ranuras PCI-E utilizadas para una tarjeta que admite puertos sata adicionales (suponiendo que tenía espacio y suficiente potencia en su caso). Notaría que muchos casos de MATX podrían no admitir las 6 unidades completas que la placa podría manejar, la mayoría he visto manejar 2 + 2 o 3 + 2.
Si el costo no era un objeto, se puede tirar en un SSD o incluso RAM en un puerto PCI-E. Ambas actúan como opciones de almacenamiento caras, pero INMEDO RÁPIDAS. Teniendo en cuenta que estás utilizando una placa matx, supongo que lanzar una gran cantidad en un almacenamiento muy rápido no es una opción que estás mirando, así que ignoremos esto.
Si su servidor también realiza algún tipo de enrutamiento que es común, también podría lanzar una tarjeta de red adicional (PCI-E para gig-e, PCI para 10/100). A menudo utilizo Ethernet como una forma rápida y sencilla de transferir archivos directamente de un sistema a otro también. Tener conexión inalámbrica es otra posibilidad en ese rol.
Con una placa MATX no puede esperar demasiadas tarjetas: tendría una x16 (para una tarjeta de video) y hasta 3 otras ranuras según las especificaciones. Por otro lado, en este rol, casi todo lo que necesitas está integrado, como dije, vería otras especificaciones al decidir.