Respuestas:
Presione CTRL-hy se abrirá el cuadro de diálogo Reemplazar. Escriba \\r\\n"Buscar qué" y \r\n"Reemplazar con". Finalmente, seleccione el modo de búsqueda Extendido (\ r, \ n, \ t, \ x ..., \ 0) y haga clic en "Reemplazar todo".
En la pantalla de búsqueda, en la pestaña reemplazar, seleccione búsqueda extendida.
En el cuadro de texto buscar poner \\r\\n, y en el cuadro de texto reemplazar poner \r\n.
Probé la respuesta más votada, pero no pude hacer que funcionara para mi versión más reciente de Notepad ++. Tuve que revertir lo que hicieron. Entonces:
Presione CTRL-hy se abrirá el cuadro de diálogo Reemplazar. Escriba \r\n"Buscar qué" y \\r\\n"Reemplazar con". Luego seleccione el modo de búsqueda Extendido (\ r, \ n, \ t, \ x ..., \ 0) y haga clic en "Reemplazar todo".
Literalmente, lo que hizo Marcus pero al revés funcionó para mí.
\r\nen el archivo, mientras que la pregunta es sobre convertir el literal \r\na nuevas líneas